如何将整个data.frame转换为数值

时间:2018-10-20 20:17:30

标签: r dataframe

我想将包含超过130列的整个data.frame转换为数字。

我知道我需要使用as.numeric,但是问题是我必须将此功能分别应用于130列中的每一列。我尝试将其应用于整个data.frame,但收到以下错误消息:

Error: (list) object cannot be coerced to type 'double'

如何用较短的代码做到这一点?

4 个答案:

答案 0 :(得分:2)

带有dplyr

的选项
library(dplyr)
df1 %>%
   mutate_all(as.numeric)

如果列是factor类,请转换为character,然后转换为numeric

df1 %>%
    mutate_all(funs(as.numeric(as.character(.)))

另外,请注意,如果任何单元格中没有character元素,则在type.convert列上使用character

df1 %>%
    mutate_all(funs(type.convert(as.character(.)))

如果效率很重要,则一个选择是data.table

library(data.table)
DF1 <- copy(DF) # from other post
system.time({setDT(DF1)
    for(j in seq_along(DF1)) set(DF1, i = NULL, j=j, value = as.numeric(DF1[[j]]))
  })
#   user  system elapsed 
#  0.032   0.005   0.037 

答案 1 :(得分:2)

在基数R中,我们可以这样做:

df[] <- lapply(df, as.numeric)

df[cols_to_convert]  <- lapply(df[cols_to_convert], as.numeric)

这里是解决方案的基准(忽略有关因素的考虑):

DF <- data.frame(a = 1:10000, b = letters[1:10000],
                 c = seq(as.Date("2004-01-01"), by = "week", len = 10000),
                 stringsAsFactors = TRUE)
DF <- setNames(do.call(cbind,replicate(50,DF,simplify = F)),paste0("V",1:150))

dim(DF)
# [1] 10000   150

library(dplyr)
n1tk  <- function(x) data.frame(data.matrix(x))
mm    <- function(x) {x[] <- lapply(x,as.numeric); x}
akrun <- function(x) mutate_all(x, as.numeric)
mo    <- function(x)  {for(i in 1:150){ x[, i] <- as.numeric(x[, i])}}

microbenchmark::microbenchmark(
  akrun = akrun(DF),
  n1tk  = n1tk(DF),
  mo    = mo(DF),
  mm    = mm(DF)
)

# Unit: milliseconds
#   expr      min        lq       mean    median        uq      max neval
#  akrun 152.9837 177.48150 198.292412 190.38610 206.56800 432.2679   100
#   n1tk  10.8700  14.48015  22.632782  17.43660  21.68520  89.4694   100
#     mo   9.3512  11.41880  15.313889  14.71970  17.66530  37.6390   100
#     mm   4.8294   5.91975   8.906348   7.80095  10.11335  71.2647   100

答案 2 :(得分:1)

Convert a Data Frame to a Numeric Matrix

例如,我们有以下数据框:

DF <- data.frame(a = 1:3, b = letters[10:12],
                  c = seq(as.Date("2004-01-01"), by = "week", len = 3),
                  stringsAsFactors = TRUE)
> DF
  a b          c
1 1 j 2004-01-01
2 2 k 2004-01-08
3 3 l 2004-01-15

要转换为数字并具有数据框,可以使用:

DF2 <- data.frame(data.matrix(DF))
> DF2
  a b     c
1 1 1 12418
2 2 2 12425
3 3 3 12432
     

注意:如果需要特定的列,则可以对需要的数据框列进行切片,例如:“ DF [1:3]”

答案 3 :(得分:0)

谢谢您,解决方案有效。我首先尝试使用此代码:

for(i in 1:140){
  mydata[, i] <- as.numeric(mydata[, i])
}

但是我认为您的解决方案更容易。

akrun,是的,我知道我们需要先将因子转换为字符,然后再转换为数字。