我正在寻找有关如何在R的闪亮程序中识别内存泄漏的一般想法。我正在努力确定泄漏的确切来源,因此很难重新创建,并且我的代码已超过1000线。我确定它与观察和观察事件有关,但是我无法确切指出。我实际上很喜欢bborgeser在这里提出的想法,使用的是reactlog选项:https://github.com/rstudio/shiny/issues/1591但是,当我尝试这样做时,showReactLog()将不会加载。我猜我的代码太大了。
所以我的主要问题是,识别内存泄漏的最佳方法是什么?我使用pryr包来跟踪每次提交后使用的内存。所以我可以说内存正在增加。我发现了其他几篇有关内存泄漏的文章,但它们更多地是要解决的特定问题,而不是一般性的问题:https://github.com/rstudio/shiny/issues/931
由于有些人可以更好地看到一些实际的代码,所以我尽力使它更简洁地重新创建。这将使其增加约0.3 mb。也许与在列表中使用列表有关?我已经玩了好几周了,但并没有取得任何进展。
在这段代码中,我知道内存泄漏肯定是在响应式/观察式中。如果我阻止这些,则内存不会增加。但我确定您可以使用反应式观察并无需增加内存。因此,这使我回到了最初的问题,在本例中,我是通过缓慢地遮挡各个部分来找到它的,但是即使我在较大的代码上尝试使用它,也无法真正确定它来自哪个部分。那么人们如何去发现他们的泄漏?
#Library Load##########################################################################################
lapply(c("shiny","tidyverse","shinydashboard","shinyjs","pryr"),require,character.only = T)
#ui, shiny body#########################################################################################
body<-dashboardBody(
useShinyjs(),
({
tabs<-lapply(1:length(1:8), function(x){
tabPanel(box(title = paste0('Tab ',x), width = NULL),
fluidPage(
div(id = paste0("BOX_",x),
column(width = 6, align = "center",
lapply(seq(1,15,2),function(y){
div(id = paste0("Box_ID_",x,"_",y),
box(width = NULL, title = paste0("Reading",((y/2)+.5)),
column(width = 4,
numericInput(paste0("Number_",x,"_",y), label = paste0("Number - ",y), value = 0, min = 0, max = 60, step = .1)),
column(width = 4,
numericInput(paste0("Number_",x,"_",y+1), label = paste0("Number - ",y+1), value = 0, min = 0, max = 60, step = .1))))
})),
column(width = 2, align = "center",
actionButton(paste0("Complete_",x),"Complete"))
)))
})
do.call(tabBox, c(tabs, list(width = NULL)))
}))
##UI combination###################
ui<-dashboardPage(
dashboardHeader(disable = T),
dashboardSidebar(disable = T),
body)
#######Server################
server <- function(input, output, session) {
#Tab 1 - Reactive Average
Avg<-reactive({
lapply(1:8, function(x) {
lapply(seq(1,15,2),function(y){
req(input[[paste0("Number_",x,"_",y)]],input[[paste0("Number_",x,"_",y+1)]])
if(input[[paste0("Number_",x,"_",y)]] == 0 | input[[paste0("Number_",x,"_",y+1)]] == 0) {0} else {
(input[[paste0("Number_",x,"_",y)]]+input[[paste0("Number_",x,"_",y+1)]])/2}
})
})
})
#Tab 1 - Show or hide boxes
lapply(1:8, function(x) {
lapply(seq(1,15,2),function(y){
observe({
req(input[[paste0("Number_",x,"_",y)]],input[[paste0("Number_",x,"_",y+1)]])
if(y == 1 & Avg()[[x]][[(y/2)+.5]] <= 30) {
shinyjs::show(paste0("Box_ID_",x,"_",1))
shinyjs::hide(paste0("Box_ID_",x,"_",3))
} else if(y == 1 & Avg()[[x]][[(y/2)+.5]] > 30) {
shinyjs::show(paste0("Box_ID_",x,"_",1))
shinyjs::show(paste0("Box_ID_",x,"_",3))
} else if(Avg()[[x]][[(y/2)+.5]] > 30) {
shinyjs::show(paste0("Box_ID_",x,"_",y+2))
} else {shinyjs::hide(paste0("Box_ID_",x,"_",y+2))}
})
})
})
#Tab 1 - Submit Button - Reset boxes, create data frame and append to file.
lapply(1:8,function(x){
observeEvent(input[[paste0("Complete_",x)]],{
#Reset the page
reset(paste0("BOX_",x))
#Garabage collect
gc()
#Print memory used. Tracking memory leaks
print(mem_used())
})
})
}
shinyApp(ui, server)