跨小提琴图填充条件将散点与直线配对

Question

这是一个数据帧，其中三个主题采用2 x 2设计：

x<-data.frame("sub" = rep(c("sub1","sub2","sub3"),times=4),
          "cond1" = rep(c("A","B"),times=c(6,6)),
          "cond2" = rep(c("C","C","C","D","D","D"),times=2),
          "score" = c(6,5,4, 5,4,3, 4,3,2, 3,2,1))

这是分开的小提琴图（对于功能，https://gist.github.com/Karel-Kroeze/746685f5613e01ba820a31e57f87ec87）：

dodge <- position_dodge(width=.5)
ggplot(x, aes(x=cond1, y=score, fill=cond2))+
  geom_split_violin(trim = F)+
  geom_point(shape=16,position=dodge)

我想做的是用填充条件上的一条线连接各个主题散点（例如，cond1 A和cond2 C中的sub1将连接到cond1 A和cond2 D中的sub1）。有人知道这是否可能吗？

Answer 1

这是一种方法。首先，我spread表，以便geom_segment的开头和结尾可以基于不同的列。然后，我将cond1的值转换为数字（这是ggplot所做的事情）并将其输入x字段。 x闪避偏移量为0.12是手动的，但可能有一种聪明的方法（超出我目前的理解）使用ggplot设置自动确定该值。

library(tidyverse)
dodge <- position_dodge(width=.5)
ggplot(x, aes(x=cond1, y=score, fill=cond2))+
  geom_split_violin(trim = F)+
  geom_point(shape=16,position=dodge) +
  geom_segment(data = x %>% spread(cond2, score),
               aes(x    = as.numeric(cond1) - 0.12, 
                   xend = as.numeric(cond1) + 0.12,
                   y = C, yend = D), inherit.aes = FALSE, color = "black")