我仍然是python的新用户,并尝试使用python制作最长的普通子序列。但是我想知道如何创建一个循环来首先逐行比较值。这是数据示例。
row col1 col2 col3 col4 col5 col6
0 'A' '11' 'B' '122' '' ''
1 'A' '11' 'B' '122' '121' ''
2 'A' '12' 'B' '123' '124' ''
3 'A' '13' 'B' '123' '124' '456'
这是我要适应的LCS的示例代码。
import pandas as pd
df_hier = pd.read_csv("sample.csv")
row1 = df_hier.iloc[1:2, 2:20]
row2 = df_hier.iloc[3:4, 2:20]
def lcs(s1, s2):
matrix = [["" for x in range(len(s2))] for x in range(len(s1))]
for i in range(len(s1)):
for j in range(len(s2)):
if s1[i] == s2[j]:
if i == 0 or j == 0:
matrix[i][j] = s1[i]
else:
matrix[i][j] = matrix[i-1][j-1] + s1[i]
else:
matrix[i][j] = max(matrix[i-1][j], matrix[i][j-1], key=len)
cs = matrix[-1][-1]
return len(cs), cs
print(lcs(row1, row2))
假设
the row1 will use
'A' '11' 'B' '122' '121' ''
and row2
'A' '12' 'B' '123' '124' ''
预期结果将是
(7,'A1B1212')
答案 0 :(得分:0)
没有那么困难。您只需要使用zip形成值对,然后应用您已经拥有的lcs
函数即可。试试这个功能:
def lcs_rows(r1, r2):
pairs = zip(r1.values.flatten(), r2.values.flatten())
lcss = [lcs(*x) if len(x[0]) and len(x[1]) else (0, '') for x in pairs]
nums = [x[0] for x in lcss]
strs = [x[1] for x in lcss]
return (sum(nums), ''.join(strs))