Question

我有这样的文件名：

func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz
func/sub-01_task-pfobloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz
func/sub-01_task-rest_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz

，并且我想从每个文件名中提取该部分，直到并包括单词bold，以便最终得到：

func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold
func/sub-01_task-pfobloc_run-01_bold
func/sub-01_task-rest_run-01_bold

有什么想法怎么做？

Answer 1

最简单的方法是删除bold及其后的所有内容，然后替换bold。显然，这种情况只有在终止字符串固定的情况下才有效。

$ f=func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz
$ echo "${f%%bold*}"
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_
$ echo "${f%%bold*}bold"
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold

Answer 2

您想要这样的东西吗？

echo func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz | sed -e 's#bold_.*$#bold#'

希望这会有所帮助

Answer 3

（不必要）这很聪明：删除以“ bold”结尾的前缀然后根据剩余的后缀长度进行一些子字符串索引运算：

$ file=func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz
$ tmp=${file#*bold}
$ keep=${file:0:${#file}-${#tmp}}
$ echo "$keep"
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold

如果$ file不包含“ bold”，则$ keep将为空：如果为空，我们可以给它$ file的值：

$ file=foobar
$ tmp=${file#*bold}
$ keep=${file:0:${#file}-${#tmp}}
$ : ${keep:=$file}
$ echo "$keep"
foobar

但是请认真做what chepner suggests。

Answer 4

使用Perl

> echo "func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz" | perl -e 'while (<>) { $_=~s/(.*bold)(.*)/\1/g; print } '
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold
>

Answer 5

这类似于glenn的解决方案，但是有点“不太聪明”，因为它不使用子字符串，而只是嵌套替换：

$ while IFS= read -r fname; do echo "${fname%"${fname#*bold}"}"; done < infile
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold
func/sub-01_task-pfobloc_run-01_bold
func/sub-01_task-rest_run-01_bold

替换"${fname%"${fname#*bold}"}"说：

从每个文件名的末尾删除"${fname#*bold}"，
"${fname#*bold}"是从文件名开头删除的bold之前的所有内容

第一个包含显式中间步骤的文件名的示例：

$ fname=func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.gz
$ echo "${fname#*bold}"
_space-T1w_preproc.nii.gz
$ echo "${fname%"${fname#*bold}"}"
func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold

Answer 6

f=func/sub-01_task-biommtloc_run-01_bold_space-T1w_preproc.nii.g
echo "${f//bold*/bold}"

Answer 7

我建议使用sed来完成此任务。首先，将所有输入的文件名粘贴到文件中，在当前目录中将其命名为namelist.txt。只要您的sed支持扩展的正则表达式（多数情况下，尤其是GNU sed），以下内容将起作用。请注意，平台之间扩展正则表达式的标志可能有所不同，请查看sed手册页。在我的Linux上是-r。

bash -c "sed -r 's/(sub-01_task-.{1,10}_run-01_bold).+/\\1/' namelist.txt"

使用bash工具提取子字符串，直到并包括匹配的单词

7 个答案: