如何从boot.hclust对象(pvclust)中提取节点位置?

时间:2018-10-10 19:33:48

标签: r dendrogram hclust pvclust

我知道我可以从pvclust的最终对象中获得au / bp数,但是我无法弄清楚哪些样本或边缘与之相关。我正在尝试将au值分配给样本。谢谢!

data(lung)
lung.pv <- pvclust(lung, nboot=10)
lung.pv$edges    ######## how is this list sorted??
head(lung.pv$edges)
        au        bp     se.au      se.bp          v         c      pchi
1 1.000000 1.0000000 0.0000000 0.00000000  0.0000000 0.0000000 0.0000000
2 1.000000 1.0000000 0.0000000 0.00000000  0.0000000 0.0000000 0.0000000
3 1.000000 1.0000000 0.0000000 0.00000000  0.0000000 0.0000000 0.0000000
4 1.000000 1.0000000 0.0000000 0.00000000  0.0000000 0.0000000 0.0000000
5 1.000000 1.0000000 0.0000000 0.00000000  0.0000000 0.0000000 0.0000000
6 0.904316 0.6440696 0.1353608 0.05082595 -0.8379504 0.4685922 0.9273748

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