我正在使用nii.gz格式的图像。因此,我正在使用nibabel来打开它们。问题是,当我打开图像,将其转换为numpy数组并将其转换回Nifti格式时,输出大小会更改。顺序是:
nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')
初始文件为~45 MB
,运行上面的代码后,图像为~65 MB
。我知道原始图像是16位编码的。我最初的理论是,当转换为numpy数组时,它们被编码为64-bit
,的确如此。所以我尝试了以下方法:
nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
np_img = np_img.astype(numpy.float16, copy=False)
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')
但是,输出的大小仍为~65MB
。任何想法为什么会这样?
答案 0 :(得分:0)
您应该将原始nifti仿射和标题信息添加到输出nifti。例如,在您的情况下:
Activities