清理Fasta文件头

时间:2018-10-08 10:19:24

标签: awk

我有一个很大的fasta文件,其标题是这样的

>sample_1 M04839:239:000000000-BVKC2:1:1105:7523:23617;size=450

我想要的输出是

>sample_1;size=450

我该如何改变呢?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

请您尝试以下。

awk -F'[ :;]' '{print $1,$NF}' OFS=";"  Input_file
>sample_1;size=450