Question

我已经使用Rocker映像将Rstudio设置为服务器上的容器。我的MySQL实例不在docker中，并且正在主机上运行。 db是生产数据库-因此也无法对数据库进行dockerise。

我可以从运行RStudio的Docker容器内部连接到主机MySQL吗？ RStudio容器运行完美，它只是在我尝试连接到“外部” MySQL并将数据写入db时出现问题。

当前尝试将R挂在最后：

library(RMySQL)
library(DBI)
  db_user <- Sys.getenv("server_user")
  db_password <- Sys.getenv("server_pass")
  db_host <- '172.17.0.1' # docker ip
  db_dbname <- "test"

  mydb <-
    dbConnect(
      MySQL(),
      user = db_user,
      password = db_password,
      dbname = db_dbname,
      host = db_host, 
      port = 3306
    )
Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Can't connect to MySQL server on '172.17.0.1' (107)

更新，破解解决方案：

想要使容器与所有端口映射一起运行，我最终在iptables中添加了一条规则，并连接到数据库，就像我从另一台服务器连接到数据库一样：

sudo iptables -I INPUT 5 -p tcp -s 172.17.0.2 --dport 3306 -m conntrack --ctstate NEW,ESTABLISHED -j ACCEPT -m comment --comment "docker DB access"

我还在MySQL中创建了一个特殊的docker用户，可以访问数据库：

CREATE USER 'docker'@'172.17.0.2' IDENTIFIED BY 'XXX';
GRANT SELECT, INSERT, CREATE ON *.* 'docker'@'172.17.0.2' IDENTIFIED BY 'XXX';

尽管有点hack，但我避免了--net ='host'带来的所有问题

Answer 1

是的。您可以以host模式运行图像。

docker run --net="host" ...

如果使用host模式，则意味着您无法监听容器中的同一端口，因为这将导致port already bind error。

以host模式运行容器时，您可以访问主机的服务器。这是带有127.0.0.1而不是172.17.0.1的MySQL。

从rstudio docker

1 个答案: