在多级自联接的图式查询中提高Postgres性能(与Neo4j相比)

时间:2018-10-05 23:25:31

标签: sql postgresql neo4j

claims Neo4j makes in their marketing之一是关系数据库不擅长进行多级自联接查询:

enter image description here

我发现code repository与声称该书的来源相对应,并且translated it to Postgres

CREATE TABLE t_user (
  id bigserial PRIMARY KEY,
  name text NOT NULL
);

CREATE TABLE t_user_friend (
  id bigserial PRIMARY KEY,
  user_1 bigint NOT NULL REFERENCES t_user,
  user_2 bigint NOT NULL REFERENCES t_user
);

CREATE INDEX idx_user_friend_user_1 ON t_user_friend (user_1);
CREATE INDEX idx_user_friend_user_2 ON t_user_friend (user_2);

/* Create 1M users, each getting a random 10-character name */
INSERT INTO t_user (id, name)
  SELECT x.id, substr(md5(random()::text), 0, 10)
  FROM generate_series(1,1000000) AS x(id);

/* For each user, create 50 random friendships for a total of 50M friendship records */
INSERT INTO t_user_friend (user_1, user_2)
  SELECT g1.x AS user_1, (1 + (random() * 999999)) :: int AS user_2
  FROM generate_series(1, 1000000) as g1(x), generate_series(1, 50) as g2(y);

这些是Neo4j与之进行比较的各种深度的查询:

/* Depth 2 */

SELECT
  COUNT(DISTINCT f2.user_2) AS cnt 
FROM
  t_user_friend f1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f2 
    ON f1.user_2 = f2.user_1 
WHERE
  f1.user_1 = 1;

/* Depth 3 */

SELECT
  COUNT(DISTINCT f3.user_2) AS cnt 
FROM
  t_user_friend f1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f2 
    ON f1.user_2 = f2.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f3 
    ON f2.user_2 = f3.user_1 
WHERE
  f1.user_1 = 1;

/* Depth 4 */

SELECT
  COUNT(DISTINCT f4.user_2) AS cnt 
FROM
  t_user_friend f1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f2 
    ON f1.user_2 = f2.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f3 
    ON f2.user_2 = f3.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f4 
    ON f3.user_2 = f4.user_1 
WHERE
  f1.user_1 = 1;

/* Depth 5 */

SELECT
  COUNT(DISTINCT f5.user_2) AS cnt 
FROM
  t_user_friend f1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f2 
    ON f1.user_2 = f2.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f3 
    ON f2.user_2 = f3.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f4 
    ON f3.user_2 = f4.user_1 
  INNER JOIN
    t_user_friend f5 
    ON f4.user_2 = f5.user_1 
WHERE
  f1.user_1 = 1;

我大致能够重现该书所声称的结果,从而对100万用户,5000万友谊建立了这样的执行时间:

| Depth | Count(*) | Time (s) |
|-------|----------|----------|
| 2     | 2497     | 0.067    |
| 3     | 117301   | 0.118    |
| 4     | 997246   | 8.409    |
| 5     | 999999   | 214.56   |

(这里是EXPLAIN ANALYZE of a depth 5 query

我的问题是,是否有一种方法可以改善这些查询的性能,以达到或超过深度5级时Neo4j的〜2s执行时间?

我尝试使用此递归CTE:

WITH RECURSIVE chain(user_2, depth) AS (
  SELECT t.user_2, 1 as depth
  FROM t_user_friend t
  WHERE t.user_1 = 1
UNION
  SELECT t.user_2, c.depth + 1 as depth
  FROM t_user_friend t, chain c
  WHERE t.user_1 = c.user_2
  AND depth < 4
)
SELECT COUNT(*)
FROM (SELECT DISTINCT user_2 FROM chain) AS temp;

但是它仍然很慢,深度4需要5秒,深度5需要48秒(EXPLAIN ANALYZE

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

我想从一开始就注意到,比较关系数据库和非关系数据库不是按需比较。

随着数据的更新,非关系数据库可能会维护一些额外的预先计算的结构。这会使更新速度稍慢,并且需要更多的磁盘空间。您使用的纯关系模式没有任何多余的东西,这使得更新尽可能快,并使磁盘使用率保持在最低水平。

我将重点介绍给定架构可以完成的事情。


起初我会做一个综合索引

CREATE INDEX idx_user_friend_user_12 ON t_user_friend (user_1, user_2);

一个这样的索引就足够了。

然后,我们知道总共只有100万用户,因此最终结果不能超过1M。

5级查询最终生成312.5M行(50 * 50 * 50 * 50 * 50)。这远远超过了最大可能的结果,这意味着有很多重复项。

因此,我将尝试实现中间结果并在流程的早期消除重复项。

我们知道Postgres实现了CTE,所以我会尝试使用它。

类似这样的东西:

WITH
CTE12
AS
(
    SELECT
        DISTINCT f2.user_2
    FROM
        t_user_friend f1 
        INNER JOIN t_user_friend f2 ON f1.user_2 = f2.user_1
    WHERE
        f1.user_1 = 1
)
,CTE3
AS
(
    SELECT
        DISTINCT f3.user_2
    FROM
        CTE12
        INNER JOIN t_user_friend f3 ON CTE12.user_2 = f3.user_1
)
,CTE4
AS
(
    SELECT
        DISTINCT f4.user_2
    FROM
        CTE3
        INNER JOIN t_user_friend f4 ON CTE3.user_2 = f4.user_1
)
SELECT
    COUNT(DISTINCT f5.user_2) AS cnt
FROM
    CTE4
    INNER JOIN t_user_friend f5 ON CTE4.user_2 = f5.user_1
;

SELECT DISTINCT最有可能需要排序,这将允许使用合并联接。


据我从https://explain.depesz.com/s/Sjov以上查询的执行计划中可以了解到,Postgres不够聪明,会进行一些不必要的排序。另外,它为某些SELECT DISTINCT使用哈希聚合,这需要额外的排序。

因此,下一个尝试将是为每个步骤显式地使用具有适当索引的临时表。

此外,我将idx_user_friend_user_12索引定义为唯一。它可能为优化器提供了额外的提示。

看看以下内容的执行情况会很有趣。

CREATE TABLE temp12
(
    user_2 bigint NOT NULL PRIMARY KEY
);
CREATE TABLE temp3
(
    user_2 bigint NOT NULL PRIMARY KEY
);
CREATE TABLE temp4
(
    user_2 bigint NOT NULL PRIMARY KEY
);

INSERT INTO temp12(user_2)
SELECT
    DISTINCT f2.user_2
FROM
    t_user_friend f1 
    INNER JOIN t_user_friend f2 ON f1.user_2 = f2.user_1
WHERE
    f1.user_1 = 1
;

INSERT INTO temp3(user_2)
SELECT
    DISTINCT f3.user_2
FROM
    temp12
    INNER JOIN t_user_friend f3 ON temp12.user_2 = f3.user_1
;

INSERT INTO temp4(user_2)
SELECT
    DISTINCT f4.user_2
FROM
    temp3
    INNER JOIN t_user_friend f4 ON temp3.user_2 = f4.user_1
;

SELECT
    COUNT(DISTINCT f5.user_2) AS cnt
FROM
    temp4
    INNER JOIN t_user_friend f5 ON temp4.user_2 = f5.user_1
;

DROP TABLE temp12;
DROP TABLE temp3;
DROP TABLE temp4;

作为显式临时表的额外好处,您可以测量每个额外级别花费的时间。