按列拆分分隔文件到较小的文件

时间:2011-03-10 20:59:12

标签: linux bash unix split cut

我熟悉linux中的split命令。如果我有一个100行的文件,

split -l 5 myfile.txt

...将myfile.txt分成20个文件,每个文件有5行,并将它们写入文件。

我的问题是,我希望按列进行此操作。如果文件有100列,制表符分隔,是否有类似的命令将此文件拆分为20个较小的文件,每个文件有5列和所有行?

我知道如何使用剪切,但是我希望有一个简单的UNIX命令,我从来没有听说过,如果不用perl或其他东西剪切,就可以实现这一目的。

提前致谢。

7 个答案:

答案 0 :(得分:8)

#!/bin/bash

(($# == 2)) || { echo -e "\nUsage: $0 <file to split> <# columns in each split>\n\n"; exit; }

infile="$1"

inc=$2
ncol=$(awk 'NR==1{print NF}' "$infile")

((inc < ncol)) || { echo -e "\nSplit size >= number of columns\n\n"; exit; }

for((i=0, start=1, end=$inc; i < ncol/inc + 1; i++, start+=inc, end+=inc)); do
  cut -f$start-$end "$infile" > "${infile}.$i"
done

答案 1 :(得分:3)

如果你只需要一个QAD(Quick&amp; Dirty)解决方案,在我的情况下是一个固定的8列;分开的csv

#!/bin/bash
# delimiter is ;
cut -d';' -f1 "$1" > "${1}.1"
cut -d';' -f2 "$1" > "${1}.2"
cut -d';' -f3 "$1" > "${1}.3"
cut -d';' -f4 "$1" > "${1}.4"
cut -d';' -f5 "$1" > "${1}.5"
cut -d';' -f6 "$1" > "${1}.6"
cut -d';' -f7 "$1" > "${1}.7"
cut -d';' -f8 "$1" > "${1}.8"

答案 2 :(得分:1)

感谢您的帮助。我希望有一个类似于split的unix命令,但我最终通过SiegeX的建议用perl包装了cut命令。

#!/usr/bin/perl

chomp(my $pwd = `pwd`);
my $help = "\nUsage: $0 <file to split> <# columns in each split>\n\n";
die $help if @ARGV!=2;


$infile = $ARGV[0];
chomp($ncol = `head -n 1 $infile | wc -w`);

$start=1;
$inc = $ARGV[1];
$end = $start+$inc-1;

die "\nSplit size >= number of columns\n\n" if $inc>=$ncol;

for($i=1 ; $i<$ncol/$inc +1 ; $i++) {
    if ($end>$ncol) {$end=$ncol;}
    `cut -f $start-$end $infile > $infile.$i`;
    $start += $inc;
    $end += $inc;
}

答案 3 :(得分:0)

# do something smarter with output files (& clear on start)
XIFS="${IFS}"
IFS=$'\t'
while read -a LINE; do 
  for (( i=0; i< ${#LINE[@]}; i++ )); do
    echo "${LINE[$i]}" >> /tmp/outfile${i}
  done
done < infile
IFS="${XIFS}"

尝试上述...使用文件名'infile'

请注意保存和恢复IFS(有没有人有更好的想法?子shell?)

另请注意,如果您再次运行,则会附加此选项 - 您可能希望删除之前运行的输出...

答案 4 :(得分:0)

在这里你有我的解决方案:

首先是输入生成器:

    1 #!/usr/bin/env ruby                                                                                                                                                                                       
    2 #                                                                                                                                                                                                         
    3 def usage(e)                                                                                                                                                                                              
    4   puts "Usage #{__FILE__} <n_rows> <n_cols>"                                                                                                                                                              
    5   exit e                                                                                                                                                                                                  
    6 end                                                                                                                                                                                                       
    7                                                                                                                                                                                                           
    8 usage 1 unless ARGV.size == 2                                                                                                                                                                             
    9                                                                                                                                                                                                           
   10 rows, cols = ARGV.map{|e| e.to_i}                                                                                                                                                                         
   11 (1..rows).each do |l|                                                                                                                                                                                     
   12   (1..cols).each {|c| printf "%s ", c }                                                                                                                                                                   
   13   puts ""                                                                                                                                                                                                 
   14 end 

拆分工具:

    1 #!/usr/bin/env ruby                                                                                                                                                                                       
    2 #                                                                                                                                                                                                         
    3                                                                                                                                                                                                           
    4 def usage(e)                                                                                                                                                                                              
    5   puts "Usage #{__FILE__} <column_start> <column_end>"                                                                                                                                                    
    6   exit e                                                                                                                                                                                                  
    7 end                                                                                                                                                                                                       
    8                                                                                                                                                                                                           
    9 usage 1 unless ARGV.size == 2                                                                                                                                                                             
   10                                                                                                                                                                                                           
   11 c_start, c_end = ARGV.map{|e| e.to_i}                                                                                                                                                                     
   12 i = 0                                                                                                                                                                                                     
   13 buffer = []                                                                                                                                                                                               
   14 $stdin.each_line do |l|                                                                                                                                                                                   
   15   i += 1                                                                                                                                                                                                  
   16   buffer << l.split[c_start..c_end].join(" ")                                                                                                                                                             
   17   $stderr.printf "\r%d", i if i % 100000 == 0                                                                                                                                                             
   18 end                                                                                                                                                                                                       
   19 $stderr.puts ""                                                                                                                                                                                           
   20 buffer.each {|l| puts l}

请注意,拆分工具会将数字值转储给stderr 它正在处理中,所以你可以知道它的进展速度。

另外,我假设分隔符是一个空格。

如何运行它的示例:

 $ time ./gen.data.rb 1000 10 | ./split.rb 0 4 > ./out

生成1000行,每行10列,并拆分前5列。我用时间(1) 测量运行时间。

我们可以使用一点oneliner来执行您请求的拆分(顺序)。这个很 易于在单个节点中并行处理(检查bash构建命令等待)或 将它们发送到集群。

$ ruby -e '(0..103).each {|i| puts "cat input.txt | ./split.rb #{i-4} #{i} > out.#{i/4}" if i % 4 == 0 && i > 0}' | /bin/bash

基本上产生:

cat input.txt | ./split.rb 0 4 > out.1
cat input.txt | ./split.rb 4 8 > out.2
cat input.txt | ./split.rb 8 12 > out.3
cat input.txt | ./split.rb 12 16 > out.4
cat input.txt | ./split.rb 16 20 > out.5
cat input.txt | ./split.rb 20 24 > out.6
cat input.txt | ./split.rb 24 28 > out.7
cat input.txt | ./split.rb 28 32 > out.8
cat input.txt | ./split.rb 32 36 > out.9
cat input.txt | ./split.rb 36 40 > out.10
cat input.txt | ./split.rb 40 44 > out.11
cat input.txt | ./split.rb 44 48 > out.12
cat input.txt | ./split.rb 48 52 > out.13
cat input.txt | ./split.rb 52 56 > out.14
cat input.txt | ./split.rb 56 60 > out.15
cat input.txt | ./split.rb 60 64 > out.16
cat input.txt | ./split.rb 64 68 > out.17
cat input.txt | ./split.rb 68 72 > out.18
cat input.txt | ./split.rb 72 76 > out.19
cat input.txt | ./split.rb 76 80 > out.20
cat input.txt | ./split.rb 80 84 > out.21
cat input.txt | ./split.rb 84 88 > out.22
cat input.txt | ./split.rb 88 92 > out.23
cat input.txt | ./split.rb 92 96 > out.24
cat input.txt | ./split.rb 96 100 > out.25

并通过管道进行猛击。

要小心你并行计算的进程数(或作业数),因为它会淹没你的进程 存储(除非您有独立的存储卷)。

希望有所帮助。让我们知道它的速度有多快。

-drd

答案 5 :(得分:0)

Split实际上可以通过一些预处理来实现您的目标

sed -E $'s/(([^\t]+\t){4}[^\t]+)\t/\\1\\n/g' myfile.txt | split -nr/20

这将写出20个带有x前缀的文件(在我的split版本中)。您可以通过以下方式验证此方法:

paste x* | cmp - myfile.txt

基本上这样做是使用sed将每行拆分为20行,然后使用拆分循环块将每行写入相应的文件。要使用其他分隔符,请切换表达式中的选项卡。数字4应该是每个文件的列数 - 1,而拆分结束时的20是文件数。要拆分的其他参数可用于修改写入的文件名。此示例使用bashes转义扩展将标签写入sed表达式和可以使用+运算符的sed版本,但如果系统上没有这些效果,则可以通过其他方式实现这些效果。 / p>

我在coreutils邮件列表上从Reuti获得了这个解决方案的变体。

答案 6 :(得分:0)

没有直接相似的东西可以按列拆分文件。但是,您可以直接使用AWK:

以下在包含input_file列的输出文件中拆分NUMBER

awk 'BEGIN{FS="\t"; m=NUMBER }
     { for(i=1;i<=NF;++i) { 
          s = (i%m==1 ? $i : s FS $i);                                                                                                                                                 
          if (i%m==0 || i==NF) {print s > (sprintf("out.%0.5d",int(i/m)+(i%m!=0)))}
     }}' input_file

以下在input_file个输出文件中拆分CHUNKS

awk 'BEGIN{FS="\t"; n=CHUNKS}
     (NR==1){ m=int(NF/n)+(NF%n==0) }
     { for(i=1;i<=NF;++i) { 
          s = (i%m==1 ? $i : s FS $i);                                                                                                                                                 
          if (i%m==0 || i==NF) {print s > (sprintf("out.%0.5d",int(i/m)+(i%m!=0)))}
     }}' input_file