Question

我在Linux centos上使用托管的RStudio。当我尝试安装软件包时，出现非零退出状态错误。我已经安装了R-devel。

从尝试安装软件包时将输出读取到r控制台，看来我的用户无法访问默认的库路径。

我读过this SO帖子，内容涉及添加新的库目录，甚至将其设置为默认目录。

在RStudio GUI的右下窗格中，我创建了一个新目录“ mylibs”。

我尝试根据SO帖子添加到libPaths（）：

.libPaths( c( .libPaths(), "~/mylibs") )

然后我输入了.libPaths()。

.libPaths()
[1] "/home/rstudio/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4"
[2] "/usr/lib64/R/library"                               
[3] "/usr/share/R/library"

所以看起来好像失败了。我想知道是否没有指定正确的目录。因此，在RStudio中，我键入了getwd()，这表明我在"/home/rstudio"中。因此，我尝试了：.libPaths( c( .libPaths(), "~/home/rstudio/mylibs") )

但是，当我选中.libPaths()时，没有变化，与上面显示的3相同。

如何将mylibs目录添加到.libPaths（），以便可以下载和安装软件包？

Answer 1

按从左到右的顺序呼叫.libPaths() 。在此CentOS机器上：

R> .libPaths()
[1] "/home/USER/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4" "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib64/R/library"                             "/usr/share/R/library"  
R>
R> .libPaths("/tmp")   # adding in session
R> .libPaths()
[1] "/tmp"                  "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib64/R/library"  "/usr/share/R/library"         
R>

您可以通过启动时读取的不同“点”文件（即.Renviron，.Rprofile等）来控制进入那里的内容。有关所有血腥细节，请参见help(Startup)。

编辑：关于@MtFlick的评论：

R> .libPaths("/DoesNotExist")
R> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib64/R/library"   
[3] "/usr/share/R/library"         
R>

尝试添加新的库目录

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