具有以下数据帧,组A有4个样本,B 3个样本,C 1个样本:
group data_1 data_2
0 A 1 4
1 A 2 5
2 A 3 6
3 A 4 7
4 B 1 4
5 B 2 5
6 B 3 6
7 C 1 4
我想将数据转换为numpy数组,其中每一行都是一个包含所有样本的组,对于样本较少的组,填充为零。
得到这样的数组:
[
[[1,4],[2,5],[3,6],[4,7]], # this is A group 4 samples
[[1,4],[2,5],[3,6],[0,0]], # this is B group 3 samples
[[1,4],[0,0],[0,0],[0,0]], # this is C group 1 sample
]
答案 0 :(得分:6)
首先需要添加缺失值-使用unstack
和stack
的第一个解决方案,计数器系列由cumcount
创建。
第二种解决方案使用MultiIndex
的{{3}}。
最后将lambda函数与groupby
一起使用,由reindex
转换为numpy数组,最后到列表:
g = df.groupby('group').cumcount()
L = (df.set_index(['group',g])
.unstack(fill_value=0)
.stack().groupby(level=0)
.apply(lambda x: x.values.tolist())
.tolist())
print (L)
[[[1, 4], [2, 5], [3, 6], [4, 7]],
[[1, 4], [2, 5], [3, 6], [0, 0]],
[[1, 4], [0, 0], [0, 0], [0, 0]]]
另一种解决方案:
g = df.groupby('group').cumcount()
mux = pd.MultiIndex.from_product([df['group'].unique(), g.unique()])
L = (df.set_index(['group',g])
.reindex(mux, fill_value=0)
.groupby(level=0)['data_1','data_2']
.apply(lambda x: x.values.tolist())
.tolist()
)