熊猫-按列分组并将数据转换为numpy数组

时间:2018-10-03 07:06:09

标签: python pandas pivot grouping

具有以下数据帧,组A有4个样本,B 3个样本,C 1个样本:

  group   data_1   data_2
0     A        1        4
1     A        2        5
2     A        3        6
3     A        4        7
4     B        1        4
5     B        2        5
6     B        3        6
7     C        1        4

我想将数据转换为numpy数组,其中每一行都是一个包含所有样本的组,对于样本较少的组,填充为零。

得到这样的数组:

[
   [[1,4],[2,5],[3,6],[4,7]], # this is A group 4 samples
   [[1,4],[2,5],[3,6],[0,0]], # this is B group 3 samples
   [[1,4],[0,0],[0,0],[0,0]], # this is C group 1 sample
]

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

首先需要添加缺失值-使用unstackstack的第一个解决方案,计数器系列由cumcount创建。

第二种解决方案使用MultiIndex的{​​{3}}。

最后将lambda函数与groupby一起使用,由reindex转换为numpy数组,最后到列表:

g = df.groupby('group').cumcount()
L = (df.set_index(['group',g])
       .unstack(fill_value=0)
       .stack().groupby(level=0)
       .apply(lambda x: x.values.tolist())
       .tolist())
print (L)

[[[1, 4], [2, 5], [3, 6], [4, 7]], 
 [[1, 4], [2, 5], [3, 6], [0, 0]], 
 [[1, 4], [0, 0], [0, 0], [0, 0]]]

另一种解决方案:

g = df.groupby('group').cumcount()
mux = pd.MultiIndex.from_product([df['group'].unique(), g.unique()])
L = (df.set_index(['group',g])
       .reindex(mux, fill_value=0)
       .groupby(level=0)['data_1','data_2']
       .apply(lambda x: x.values.tolist())
       .tolist()
)