如何使用rentrez提取文章的作者和链接?

时间:2018-09-30 20:59:14

标签: r list pubmed

我正在使用RENTREZ包,以检索PubMed作者的标题。我首先进行总结:

papers_summary <- (entrez_summary(db = "pubmed", web_history = r_search$web_history))

然后我尝试使用下面的函数来检索作者,但是我没有进行管理。 paper_authors <- extract_from_esummary(papers_summary, elements = "authors", simplify = F)

使用此代码,我可以获得数据帧的列表,但我只想从每篇文章中获得作者列表。

这是我得到的输出示例,但是这些元素的列表会连续运行数百次:

R: paper_authors
$`24533571`
$`24533571`$`authors`
       name authtype clusterid
1     Trittun F   Author          
2 Solboreisen B   Author          
3      Gianni C   Author

我也想获得每篇文章的链接,但我不知道怎么做。

谢谢

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