R脚本，data_path <-粘贴问题

Question

这是我在qiime论坛上共享的R脚本的顶部。该脚本旨在为多个fastq文件创建一个元数据文件。 我如何编辑它以运行而不需要每次都进行编辑，但是我似乎无法告诉它使用当前的工作主管

这是问题代码：

#!/usr/bin/env Rscript
library(tidyverse)

data_path <- paste ("./", "Data", sep = "/")

及其错误：

Error in `[<-.data.frame`(`*tmp*`, "direction", value = "forward") : 
  replacement has 1 row, data has 0
Calls: [<- -> [<-.data.frame
Execution halted

Answer 1

要将工作目录设置为“数据”文件夹：

setwd("Data/")

Answer 2

谢谢@forestfanjoe和@TingleTanglBob的帮助 对于任何想知道如何格式化setwd的人，请参见此工作示例=）

data_path <- paste (setwd ("Data/"),"Data", sep = "/")