SIMR套件-效果尺寸

时间:2018-09-24 14:09:13

标签: r mixed-models

我正在使用SIMR软件包来估计模型的功效和效果大小。但是,我不知道该程序包如何估算效果大小,以及它报告的是哪种效果(是科恩的d?)。

例如 对于我的模型,其中AQ和LSAS是连续的预测变量,而cond是绝对的(3级)预测变量,我得到以下输出(对于AQ):

> model.cnv.cue = lme4::lmer(DV ~  AQ_centr  + cond + LSAS_centr + (1 | code), data = mydata, REML = FALSE)        
> powerSim(model.cnv.cue,nsim = 200)

Power for predictor 'AQ_centr', (95% confidence interval):
      60.50% (53.36, 67.32)

Test: Kenward Roger (package pbkrtest)
      Effect size for AQ_centr is -0.048

Based on 200 simulations, (0 warnings, 0 errors)
alpha = 0.05, nrow = 153

Time elapsed: 0 h 0 m 23 s

nb: result might be an observed power calculation

是科恩的d = -0.048吗?还是r?肯沃德·罗杰(Kenward Roger)测试与此有何关系?

然后,当我为分类预测器运行它时,没有报告效果大小:

> model.cnv.cue = lme4::lmer(CNV_500_cue ~  cond + AQ_centr + LSAS_centr + (1 | code), data = ANT, REML = FALSE)
> powerSim(model.cnv.cue,nsim = 200)

Power for predictor 'cond', (95% confidence interval):
      95.50% (91.63, 97.92)

Test: Likelihood ratio

Based on 200 simulations, (0 warnings, 0 errors)

alpha = 0.05, nrow = 153

Time elapsed: 0 h 0 m 13 s

nb: result might be an observed power calculation

那么包装如何估计效果大小?以及如何获得分类预测变量的效应大小?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

效果大小-0.048是预测变量AQ_centr的斜率。 Kenward Roger检验用于计算连续预测变量的p值;为您的分类预测变量使用似然比检验。除了使用KR,您还可以使用Bootstrap等(这只是计算p值的方式)。 进入模型时,您的3级分类预测变量可能会分为2个虚拟变量。如果您对一个特定的虚拟变量(例如cond2)的效果感兴趣,则可以对其进行z检验,如下所示:

powerSim(model.cnv.cue, fixed('cond2', 'z'), nsim=200)

要了解虚拟变量,可以查看模型摘要:

summary(model.cnv.cue)$coef

更多信息可以在这里找到:

https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/2041-210X.12504

https://besjournals.onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1111%2F2041-210X.12504&file=mee312504-sup-0001-AppendixS1.html