R中的文本挖掘和返回匹配

时间:2018-09-22 16:28:06

标签: r

我有一个基因清单。我想针对数据库(例如AceView)中的关键字“ nucleus”或“ nuclei”或“ nuclear”搜索/匹配每个基因,并返回一个仅包含“ true”命中值的所有基因的数据框。 在R中可能吗? 我有一些R方面的经验,但肯定不是专家。因此,任何有关可以做到的软件包/脚本的建议都将非常有帮助。 谢谢

下面以基因列表为例。我的实际列表中包含6000多个基因。

genes = c("PPP1R12A",
"HNRNPDL",
"ARHGEF10",
"SPTBN2",
"SEC16A",
"PLXNB2",
"U2SURP",
"ARHGEF11",
"NPC1",
"SCAMP1",
"SCAMP2",
"ARPC1B",
"ARPC2",
"ARPC3")

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