我想在我拥有的所有内核上运行我的程序。这是我在程序中使用的下面的代码(它是完整程序的一部分。以某种方式,设法编写了工作流程)。
def ssmake(data):
sslist=[]
for cols in data.columns:
sslist.append(cols)
return sslist
def scorecal(slisted):
subspaceScoresList=[]
if __name__ == '__main__':
pool = mp.Pool(4)
feature,FinalsubSpaceScore = pool.map(performDBScan, ssList)
subspaceScoresList.append([feature, FinalsubSpaceScore])
#for feature in ssList:
#FinalsubSpaceScore = performDBScan(feature)
#subspaceScoresList.append([feature,FinalsubSpaceScore])
return subspaceScoresList
def performDBScan(subspace):
minpoi=2
Epsj=2
final_data = df[subspace]
db = DBSCAN(eps=Epsj, min_samples=minpoi, metric='euclidean').fit(final_data)
labels = db.labels_
FScore = calculateSScore(labels)
return subspace, FScore
def calculateSScore(cluresult):
score = random.randint(1,21)*5
return score
def StartingFunction(prvscore,curscore,fe_select,df):
while prvscore<=curscore:
featurelist=ssmake(df)
scorelist=scorecal(featurelist)
a = {'a' : [1,2,3,1,2,3], 'b' : [5,6,7,4,6,5], 'c' : ['dog', 'cat', 'tree','slow','fast','hurry']}
df2 = pd.DataFrame(a)
previous=0
current=0
dim=[]
StartingFunction(previous,current,dim,df2)
我在for
方法中有一个scorecal(slisted)
循环,该循环已被注释,需要每一列来执行DBSCAN
,并且必须根据结果计算该特定列的分数(但是我尝试在此处使用随机评分)。这种循环使我的代码可以运行更长的时间。因此,我尝试并行化DataFrame的每一列,以在我系统上具有的内核上执行DBSCAN,并以上述方式编写了代码,但并没有得到所需的结果。我是这个多处理库的新手。我不确定程序中'__main__'
的位置。我也想知道python中是否还有其他方式可以并行运行。任何帮助表示赞赏。
答案 0 :(得分:0)
您的代码具有使用多个内核在多核处理器上运行所需的全部功能。但这是一团糟。我不知道您尝试使用代码解决什么问题。另外,由于我不知道DBSCAN
是什么,因此我无法运行它。要修复您的代码,您应该执行几个步骤。
功能scorecal()
:
def scorecal(feature_list):
pool = mp.Pool(4)
result = pool.map(performDBScan, feature_list)
return result
result
是一个包含performDBSCAN()
返回的所有结果的列表。您不必手动填充列表。
程序主体:
# imports
# functions
if __name__ == '__main__':
# your code after functions' definition where you call StartingFunction()
我创建了非常简化的代码版本(具有4个进程的池来处理我的数据的8列),并使用了虚拟for循环(以实现cpu绑定操作)并进行了尝试。我获得了100%的CPU负载(我拥有4核i5处理器),与通过for循环实现单进程实现相比,自然可以使计算速度提高大约4倍(20秒vs 74秒)。
编辑。
我用来尝试多处理的完整代码(我使用Anaconda(Spyder)/ Python 3.6.5 / Win10):
import multiprocessing as mp
import pandas as pd
import time
def ssmake():
pass
def score_cal(data):
if True:
pool = mp.Pool(4)
result = pool.map(
perform_dbscan,
(data.loc[:, col] for col in data.columns))
else:
result = list()
for col in data.columns:
result.append(perform_dbscan(data.loc[:, col]))
return result
def perform_dbscan(data):
assert isinstance(data, pd.Series)
for dummy in range(5 * 10 ** 8):
dummy += 0
return data.name, 101
def calculate_score():
pass
def starting_function(data):
print(score_cal(data))
if __name__ == '__main__':
data = {
'a': [1, 2, 3, 1, 2, 3],
'b': [5, 6, 7, 4, 6, 5],
'c': ['dog', 'cat', 'tree', 'slow', 'fast', 'hurry'],
'd': [1, 1, 1, 1, 1, 1]}
data = pd.DataFrame(data)
start = time.time()
starting_function(data)
print(
'running time = {:.2f} s'
.format(time.time() - start))