我正在尝试使用Scipy
的正交距离回归(odr)包来拟合函数,但不断出现以下错误:
"RuntimeWarning: invalid value encountered in power"
当我使用scipy
的curve_fit函数时发生了这种情况,但是我总是可以放心地忽略该警告。但是现在看来,这会导致数值错误,从而导致拟合中断。我的代码基于在这里找到的示例:
python scipy.odrpack.odr example (with sample input / output)?
这是我的代码:
import numpy as np
import scipy.odr.odrpack as odrpack
def divergence(x,xDiv):
return ( 1 - (x/xDiv) )**( -2.4 )
xValues = np.linspace(.25,.37,12)
yValues = np.array([ 6.94970607, 9.12475506, 10.65969954, 12.30241672,
14.44154148, 16.00261267, 19.98693664, 25.93076421,
30.89483997, 35.27106466, 50.81645983, 68.06009144])
xErrors = .0005*np.ones(len(xValues))
yErrors = np.array([ 0.31905094, 0.37956865, 0.24837562, 0.68320078, 1.25915789,
1.40241088, 0.33305157, 1.37165251, 0.32658393, 0.52253429,
1.04506858, 1.30633573])
wcModel = odrpack.Model(divergence)
mydata = odrpack.RealData(xValues, yValues, sx=xErrors, sy=yErrors)
myodr = odrpack.ODR(mydata, wcModel, beta0=[.8])
myoutput = myodr.run()
myoutput.pprint()
通过查看有关此错误的先前问题,我在这里找到了
NumPy, RuntimeWarning: invalid value encountered in power
我怀疑问题出在,我将负值提高到了小数的幂。但是,我提升-2.4 (1-x/xDiv)
的力量并不是负面的(至少在xDiv=.8
的最初猜测附近)。但是,当我尝试将我的y值设为复杂类型时,会收到一个新错误:
"ValueError: y could not be made into a suitable array"
从命令行开始
myoutput = myodr.run().
我能找到的唯一使用此odr包的示例都适合多项式,因此我怀疑可能是问题所在?