嗨,我正在尝试获取一个整数列的总和,其中在单独的列中给出的日期在给定的参数之间。
以下SQL查询可以满足我的要求,但是在sqldf中查询速度太慢,因此我需要找到一个R等效项。数据是医院发作的数据,其中“停留”列指示该发作在医院度过的天数。 df表包含每个患者的Index和EndDate(AnonID)
SELECT m.*, b.Sum
FROM df
LEFT JOIN
(SELECT AnonID, SUM(e.Stay) AS Sum
FROM
(SELECT e.*, d.IndexDate, d.EndDate
FROM Episodes e
LEFT JOIN df d
ON e.AnonID=d.AnonID )a
WHERE AdmissionDate BETWEEN CAST(a.IndexDate AS datetime2) AND CAST(a.EndDate AS datetime2)
GROUP BY AnonID) b
答案 0 :(得分:1)
dplyr
库是R中最常用的数据处理程序包之一。
在您的特定情况下,我们需要:
left_join
for LEFT JOIN filter
for WHERE子句group_by
for GROUP BY summarise
(或summarize
)来计算聚合,例如SUM %>%
用于管道,纯粹是美观的,但是它使代码更易于阅读将所有内容放在一起,您应该具有以下内容:
library(dplyr)
eps_in_range <- episodes %>%
left_join(df, by="AnonID") %>%
filter(AdmissionDate >= IndexDate,
AdmissionDate <= EndDate) %>%
group_by(AnonID) %>%
summarise(stay_sum = sum(Stay))
df %>%
left_join(eps_in_range)
在不查看数据或不了解您想要实现的目标的情况下,很难确保这是100%正确的。希望这足以让您入门。有很多dplyr
资源。我建议您一个接一个地运行管道,以了解发生了什么。