将boot :: inv.logit()应用于R中的栅格

时间:2018-09-18 07:41:44

标签: r raster logistic-regression r-raster

我有一个Formal Class Raster,我正在尝试将 boot :: inv.logit()函数应用于其栅格像元,例如:

r1 <- raster(nrows=25, ncols=25, vals=rtnorm(n = 625, .1, .9))
r2 <- boot::inv.logit(r1)

但是,当我尝试这样做时,它会重新运行错误:

> Error in plogis(x) : Non-numeric argument to mathematical function

如果我将栅格转换为矩阵,然后返回栅格,则可以完成工作,但是我失去了与开始时拥有的“正式栅格”相关的所有其他信息,这并不理想:

r2 <- boot::inv.logit(as.matrix(r1))
r2 <- as.raster(r2)

是否有一种简单的方法来恢复我以前拥有的Formal Class Raster信息,或者将inv.logit()应用于栅格而不进行as.matrix()转换?预先谢谢你。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

如果要将功能应用于栅格,请使用calc中的raster方法:

r2 <- calc(r1,boot::inv.logit)

> r2 

# class       : RasterLayer 
# dimensions  : 25, 25, 625  (nrow, ncol, ncell)
# resolution  : 14.4, 7.2  (x, y)
# extent      : -180, 180, -90, 90  (xmin, xmax, ymin, ymax)
# coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
# data source : in memory
# names       : layer 
# values      : 0.07434905, 0.9498965  (min, max)

或者,您可以制作r1的空副本,只需填写inv.logit中的值:

r2 <- raster(r1)
r2[] <- boot::inv.logit(as.matrix(r1))