计算机绘图实用程序

时间:2011-03-08 15:14:03

标签: math r graph statistics jfreechart

我在R中开发了一个系统,用于绘制从风力涡轮机获得的大型数据集。我现在将进程移植到Java中。我在两个系统之间得到的结果是不一致的。

如下图所示:

  • 首先使用R绘制数据集,然后使用JFreeChart绘制数据集。
  • 两个图中的红线对应于我在各种语言中的各自计算(详情如下)。
  • #1中的棕色虚线对应于#2中的蓝线,此处没有差异,提供参考
  • 阴影区域代表数据点,#1为灰色,#2为红色。 Dataset graphed using R Dataset graphed using JFreeCharts

我可以解释(红色)计算线之间的差异,这是由于我使用不同的计算方法。

在R中,数据处理如下,我写了这段代码with a little help并且不知道这里发生了什么(但是,嘿,它有效)。

df <- data.frame(pwr = pwr, spd = spd)
require(mgcv)
mod <- gam(pwr ~ s(spd, bs = "ad", k = 20), data = df, method = "REML")
summary(mod)
x_grid <- with(df, data.frame(spd = seq(min(spd) + 0.0001, maxi, length=100)))
pred <- predict(mod, x_grid, se.fit = TRUE)
x_grid <- within(x_grid, fit <- pred$fit)
lines(fit ~ spd, data = x_grid, col = "red", lwd = thickLineWidth)

在Java(SQL infact)中,我使用bin的方法来计算x轴上每0.5的平均值。使用org.jfree.chart.renderer.xy.XYSplineRenderer绘制结果数据我不太了解线的呈现方式。

SELECT 
    ROUND( ROUND( x_data * 2 ) / 2, 1)   AS x_axis, # See https://stackoverflow.com/questions/5230647/mysql-rounding-functions
    AVG( y_data )                        AS y_axis 
FROM 
    table 
GROUP BY 
    x_axis

我对两个图表之间的差异采取了看法:

  • x_axis上出现单个异常值18(在R图上最明显)似乎对曲线的形状产生了巨大影响。
  • 即使在x轴上的5到15之间,R图中的线似乎更连续,它不会像Java产生的那样容易地改变轨迹。
  • 在java x轴上18处显而易见的“陨石坑”必须“m”它的每一边,我相信这是由于渲染系统中的多项式效应。

这些是我想要消除的内容。

因此,为了理解两个图表之间的区别,我有几个问题:

  • 我的R脚本究竟发生了什么?
  • 我怎样才能,或者,我是否希望将相同的进程移植到我的Java代码中?
  • 任何人都可以解释JFreeCharts使用的样条系统,还有另一个吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

在R代码中,你是(当我展示这个例子的时候),在功率和速度数据中拟合一个加法模型,其中变量之间的关系由数据本身决定。这些模型涉及使用样条来估计响应函数。特别是在这里,我使用了自适应平滑器k = 20更平滑拟合的复杂性。平滑器越复杂,拟合函数就越。自适应平滑器是指平滑度在拟合函数中变化的平滑度。

为什么这很重要?那么,根据您的数据,有些时段响应不随速度变量而变化,而响应随速度变化而快速变化的时段也是如此。我们有一个摇摆不定的“余量”用于曲线。对于普通样条曲线,整个函数的摆动(或平滑度)是相同的。通过自适应平滑,我们可以在响应变化/变化最大的函数部分中使用更多的摆动余量,而不在响应不变的部分中不需要任何余量。

下面我注释代码以解释每一步的工作:

## here we create a data frame with the pwr and spd variables
df <- data.frame(pwr = pwr, spd = spd)

## we load the package containing the code to fit the additive model
require(mgcv)

## This is the model itself, saying pwr is modelled as a smooth function of spd
## and the smooth function of spd is generated using an adaptive smoother with
## and "allowance" of 20. This allowance is a starting point and the actual
## smoothness of the curve will be estimated as part of the model fitting,
## here using a REML criterion
mod <- gam(pwr ~ s(spd, bs = "ad", k = 20), data = df, method = "REML")

## This just summarise the model fit
summary(mod)

## In this line we are creating a new spd vector (in a data frame) that contains
## 100 equally spaced spd values over the entire range of the observed spd
x_grid <- with(df, data.frame(spd = seq(min(spd) + 0.0001, maxi, length=100)))

## we will use those data to get predictions of the response pwr at each
## of the 100 values of spd we just created
## I did this so we had enough data to plot a nice smooth curve, but without
## having to predict for all the observed values of spd
pred <- predict(mod, x_grid, se.fit = TRUE)

## This line stores the 100 predicted values in the prediction data object
x_grid <- within(x_grid, fit <- pred$fit)

## This line draws the fitted smooth on to a plot of the data
## this assumes there is already a plot on the active device.
lines(fit ~ spd, data = x_grid, col = "red", lwd = thickLineWidth)

如果您不熟悉添加剂模型和平滑/样条曲线,那么我推荐Ruppert,Wand和Carroll(2003)Semiparametric Regression。剑桥大学出版社。