在Colab上安装Qiime2

时间:2018-09-13 17:09:05

标签: google-colaboratory qiime

有人对在Colab上安装Qiime2有什么建议吗?我似乎无法使其与!pip install qiime2一起使用。

1 个答案:

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是否可以在Colab中创建conda环境?如果检查QIIME2页面(下面的链接),则表明首先安装conda / miniconda,然后在conda中创建QIIME2环境。据我所知,要运行QIIME2,请使用“源激活”命令而不是基于python的命令

最好!

https://docs.qiime2.org/2018.11/install/native/