如何在并行化中使用非顶级函数?

时间:2018-09-10 22:44:09

标签: python-3.x function parallel-processing

我想在我编写的代码中使用大量处理过程,如下面的示例所示:

import numpy as np
import multiprocessing as multiproc

def function(r, phi, z, params):
    """returns an array of the timepoints and the corresponding values 
       (demanding computation in actual code, with iFFT and stuff)"""
    times = np.array([1.,2.,3.])
    tdependent_vals = r + z * times + phi
    return np.array([times, tdependent_vals])

def calculate_func(rmax, zmax, phi, param):
    rvals = np.linspace(0,rmax,5)
    zvals = np.linspace(0,zmax,5)
    for r in rvals:
        func_at_r = lambda z: function(r, phi, z, param)[1]
        with multiproc.Pool(2) as pool:
             fieldvals = np.array([*pool.map(func_at_r, zvals)])
             print(fieldvals) #for test, it's actually saved in a numpy array

calculate_func(3.,4.,5.,6.)

如果我运行此命令,它将失败并显示

AttributeError: Can't pickle local object 'calculate_func.<locals>.<lambda>'

我认为原因是,根据documentation来说,只能对顶级定义的函数进行腌制,而对我在函数中定义的lambda则不能。但是我看不出有什么办法可以使它成为一个独立的函数,至少没有用一堆顶级变量污染模块:在调用calculate_func之前参数是未知的,并且它们在rvals上的每次迭代。整个多处理对我来说还是很新的,我无法提出其他选择。在rvalszvals上并行化循环的最简单的工作方法是什么?

注意:我以这个answer为起点。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这可能不是最好的答案,但这是一个答案,所以请不要讨厌:)

您可以编写一个可以序列化并执行函数的顶级包装器函数。这有点像函数初始化,但是我在代码中解决了类似的问题。

这是一个简短的例子

def wrapper(arg_list, *args):
    func_str = arg_list[0]
    args = arg_list[1]
    code = marshal.loads(base64.b64decode(func_str.data))
    func = types.FunctionType(code, globals(), "wrapped_func")
    return func(*args)

def run_func(func, *args):
    func_str = base64.b64encode(marshal.dumps(func.__code__, 0))
    arg_list = [func_str, args]
    with mp.Pool(2) as pool:
        results = pool.map(wrapper, arg_list)
    return results