如何使用多边形函数获得密度图?我有多个组要绘制

时间:2018-09-05 04:13:50

标签: r plot polygon kernel-density density-plot

所以我在R中使用了基本数据,即“虹膜”数据

到目前为止,我所做的是创建一个向量,该向量具有Sepal.Length的x值和具有密度函数输出的y值。 然后我绘制了它们的图,但没有按我的意图显示在3个不同的组(按物种)中。

我的直觉是我的分组有问题...您能帮我吗?

<>

x<-iris$Sepal.Length
y<-iris$Species
z<-split(x,y)
x_min <- min(x)
x_max <- max(x)
a <- sapply(z, function(x) density(x,from=x_min,to=x_max))
a
for(i in 1:length(a)){
    polygon(a$x[i],a$y[i])
}

output

这是输出,看起来应该是

expected answer

非常感谢您

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

ggplot使这样的分组操作更加容易,因为您只需将分组变量映射到用于区分分组的美观度(此处为fill),并且它会为您处理颜色和图例。 (当然,您可以进一步自定义。)

library(ggplot2)

ggplot(iris, aes(Sepal.Length, fill = Species)) + geom_density()

如果要在基本绘图中执行此操作,通常最简单的方法是先设置空窗口,然后遍历各个组。由于您将要设置颜色和组,因此Maplapply更合适。图例需要打个电话。

plot(x = c(4, 8.5), y = c(0, 1.5), type = "n", 
     xlab = "Sepal Length", ylab = "Density", 
     main = "Density plot of multiple groups"); 

d <- lapply(split(iris$Sepal.Length, iris$Species), density)
Map(function(dens, col) polygon(dens, col = col), 
    dens = d, col = c('pink', 'lightgreen', 'lightblue')); 

legend("topright", levels(iris$Species), fill = c('pink', 'lightgreen', 'lightblue'))