边界细化后的分段评估不起作用

时间:2018-09-04 21:09:28

标签: format imagej

我目前正在使用来自ISBI-2012分割挑战的数据进行图像分割项目。我正在尝试通过以下链接运行BeanShell脚本:https://imagej.net/Segmentation_evaluation_after_border_thinning_-_Script

在我自己的预测分割图像上

但是,我似乎无法用图像重现结果。

predicted image

ground truth image

,结果得到this。我了解生成的单元格标签必须采用某种格式,如ISBI-2012网站上所述:

  

预计结果将以32位TIFF 3D图像的形式提交,其值介于0(100%膜确定性)和1(100%非膜确定性)之间。

但是,我很难理解如何精确地以这种格式保存图像。有什么办法可以解决这个问题?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您确实需要将图像转换为32位并使其值在[0.0 1.0]范围内。

您可以在脚本中通过在第59行之后简单添加两行来做到这一点:

IJ.run( proposedLabels, "32-bit", "" );
IJ.run( proposedLabels, "Enhance Contrast...", "saturated=0.3 normalize process_all");

地面真实图片应该是二进制的。