在lme4中考虑逻辑GLMM中的因素可变性

时间:2018-08-31 17:33:17

标签: r lme4

我们进行了一项野外研究,我们试图了解哪些因素显着说明了一组动物(总共5种)穿过30种野生动物过路设施的可能性。响应变量是二项式的(是=交叉;否=没有交叉),由动物物种记录。我们对每个交叉结构(我们的随机因子)进行了大约30次访问,在其中记录了每种动物物种的二项式响应以及一些预测因子的值。

因此,我有一个混合效果模型(为更好的理解而简化):库(lme4)

我的模型<-glmer(cross.01〜stream.01 + width.m + grass.per +(1 | structure.id),   数据= Mydata,家庭=二项式)

流是一个有两个层次的因子; width.m是连续的; grass.per是一个百分比

在此模型中,我评估了所有物种的杂交(即,任何物种的动物杂交时,杂交= 01 = 1,没有动物杂交时,杂交= 01 = 0)。但是,我们对每个物种做了一个模型,这些特定于物种的模型强调,不同物种在杂交和解释变量之间表现出不同的关系。

我的问题:这意味着我的上述模型遭受了与物种水平相关的其他变异源,而没有对其进行解释。但是,我无法通过添加物种水平作为随机因素来重新校准上述模型,因为在我的二项式响应中,零表示没有物种交叉(对于物种,所有零均具有“ NA”或“无”),因此需要其他来源仅当响应为1时才存在变异。为了确认这一点,我确实将物种添加为随机因子:

(1 | structure.id)+(1 |种)

按预期,消息为“错误:响应不变”

在lme4中如何解释模型中的物种变异性?

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