Question

这很简单，已经被询问/回答过很多次，但是当文件位于不同目录中时却并非如此。我想做这个： Renaming part of a filename，但文件位于不同的子目录中。

这是我尝试过的：

for f in */*run?.t; do mv -i -- "$f" "${f//subset/subset5}"; done

，但它也会尝试重命名目录（因为子集也位于目录名称中），然后由于未找到该目录名称而出错。我想念什么？

以下是常规目录结构：

Gene1_subset/
       Gene1file_subset.run1.t
       Gene1file_subset.run2.t
Gene2_subset/
       Gene2file_subset.run1.t
       Gene2file_subset.run2.t

这就是我想要的：

Gene1_subset/
           Gene1file_subset5.run1.t
           Gene1file_subset5.run2.t
Gene2_subset/
           Gene2file_subset5.run1.t
           Gene2file_subset5.run2.t

但是它也会尝试重命名目录，因此您会收到错误消息：

cannot move Gene1_subset/Gene1file_subset.run1 to Gene1_subset5/Gene1file_subset5.run1 : No such file or directory

Answer 1

您可以检查文件是否为目录，如果不是，则将其重命名。

例如，如果[ -d FILE ]存在并且是目录，true将返回FILE。

不要尝试从根目录移走所有内容，而是循环所有目录，并为每个目录循环所有文件。

E.G。

#!/bin/bash
rename() {
  for dir in *; do
    if [ -d "${dir}" ]; then
      cd "${dir}"
      for f in *run?; do
        ! [ -d "${f}" ] && mv -i -- "${f}" "${f//subset/subset5}"
      done
      cd ..
    fi
  done
}
rename || exit $?
exit 0

Answer 2

$ mkdir -p Gene1_subset Gene2_subset
$ touch Gene1_subset/Gene1file_subset.run1 Gene1_subset/Gene1file_subset.run2 Gene2_subset/Gene2file_subset.run1 Gene2_subset/Gene2file_subset.run2

我认为一切都归结于找到合适的正则表达式。在这里，我将字符串subset.run替换为subset5.run：

$ find . -name '*.run[0-9]' -exec sh -c 'mv -v "{}" "$(echo {} | sed "s/subset\.run/subset5\.run/")"' \;
renamed './Gene2_subset/Gene2file_subset.run2' -> './Gene2_subset/Gene2file_subset5.run2'
renamed './Gene2_subset/Gene2file_subset.run1' -> './Gene2_subset/Gene2file_subset5.run1'
renamed './Gene1_subset/Gene1file_subset.run2' -> './Gene1_subset/Gene1file_subset5.run2'
renamed './Gene1_subset/Gene1file_subset.run1' -> './Gene1_subset/Gene1file_subset5.run1'

但是我们可以例如使用basename和dirname从文件名和目录中剥离路径，然后仅对文件名运行sed：

$ find . -name '*.run[0-9]' -exec sh -c "mv -v \"{}\" \"\$(dirname \"{}\")/\$(basename \"{}\" | sed 's/subset/subset5/')\"" \;
renamed './Gene2_subset/Gene2file_subset.run2' -> './Gene2_subset/Gene2file_subset5.run2'
renamed './Gene2_subset/Gene2file_subset.run1' -> './Gene2_subset/Gene2file_subset5.run1'
renamed './Gene1_subset/Gene1file_subset.run2' -> './Gene1_subset/Gene1file_subset5.run2'
renamed './Gene1_subset/Gene1file_subset.run1' -> './Gene1_subset/Gene1file_subset5.run1'

逃避一点学习。这可能会让您更容易理解：

for f in */*run?; do f2=$(basename "$f"); mv -vi -- "$f" "$(dirname "$f")/${f2//subset/subset5}"; done
renamed 'Gene1_subset/Gene1file_subset.run1' -> 'Gene1_subset/Gene1file_subset5.run1'
renamed 'Gene1_subset/Gene1file_subset.run2' -> 'Gene1_subset/Gene1file_subset5.run2'
renamed 'Gene2_subset/Gene2file_subset.run1' -> 'Gene2_subset/Gene2file_subset5.run1'
renamed 'Gene2_subset/Gene2file_subset.run2' -> 'Gene2_subset/Gene2file_subset5.run2'

Answer 3

类似的事情应该做：

#!/usr/bin/env bash

shopt -s extglob globstar nullglob
for f in **/*_subset.run+([0-9]).t; do
    tmp=${f##*_}
    mv -i -- "$f" "${f%_*}_${tmp/et/et5}"
done

如果文件严格遵循结构，则只需将代码更改为：

mv -i -- "$f" "${f/file_subset/file_subset5}"

bash重命名不同目录中文件名的一部分

3 个答案: