样本数据
library(raster)
library(ggplot2)
my.shp <- getData('GADM', country = 'FRA', level = 1)
plot(my.shp)
如果我想使用ggplot绘制此数据:
my.shp_f <- fortify(my.shp, region = "ID_1")
ggplot(data = my.shp_f, aes(long, lat, group = group)) + geom_polygon(fill = "grey80")
问题1:为什么行政边界消失了?
问题2: 我有另一个数据框,其中包含每个行政区从第1天到第365天的2年每日降雨量数据。
rain.data <- data.frame(ID_1 = rep(my.shp@data$ID_1, each = 2 * 365),
year = rep(rep(1981:1982, each = 365), times = 2),
day = rep(1:365, times = 4),
rain = sample(1:20, replace = T, 2 * 365 * 2))
我想为此形状文件创建每日降雨量的动画 1981年1月1日至1982年365天。
目前,我的总体方法是循环播放,并将每天的降雨图保存为单独的.png
文件,然后将这些文件堆叠为.gif
。
但是,这导致我先保存了2年X 365天的.png
文件,然后将它们堆叠在一起。如果我拥有30年的数据价值,这将变得不可能。我阅读了有关gganimate
https://github.com/thomasp85/gganimate的帖子,想知道是否有人可以
演示如何使用上方的数据
答案 0 :(得分:1)
这个答案使事情朝着不同的方向发展,但我想尝试gganimate
,这是一个很好的借口。我的修改主要是使用sf
软件包和ggplot2中的新geom_sf
Geom。我不喜欢修改日期,因此可以改进。我还仅绘制了日期的子集-根据设置,您拥有的数据量可能会花费一些时间。无论如何,这就是我要做的:
library(raster)
library(ggplot2)
library(sf)
library(dplyr)
library(lubridate)
library(gganimate)
library(rmapshaper)
my.shp <- getData('GADM', country = 'FRA', level = 1)
## Convert the spatial file to sf
my.shp_sf <- st_as_sf(my.shp) %>%
ms_simplify()
## Here is how to plot without the rain data
ggplot(my.shp_sf) +
geom_sf()
## Convert your data into a date
## this is very hacky and coule be improved
rain.data <- data.frame(ID_1 = rep(my.shp@data$ID_1, each = 2 * 365),
year = rep(rep(1981:1982, each = 365), times = 2),
day = rep(1:365, times = 4),
rain = sample(1:20, replace = T, 2 * 365 * 2))
date_wo_year <- as.Date(rain.data$day -1, origin = "1981-01-01")
rain.data$Date = ymd(paste0(rain.data$year, "-",month(date_wo_year),"-", day(date_wo_year)))
## Join the rain.data with a properly formatted date with the spatial data.
joined_spatial <- my.shp_sf %>%
left_join(rain.data)
## Plot the spatial data and create an animation
joined_spatial %>%
filter(Date < as.Date("1981-02-28")) %>%
ggplot() +
geom_sf(aes(fill = rain)) +
scale_fill_viridis_c() +
theme_void() +
coord_sf(datum = NA) +
labs(title = 'Date: {current_frame}') +
transition_manual(Date)