用conda-forge软件包替换pip软件包的简便方法

时间:2018-08-24 04:47:17

标签: python python-3.x pip anaconda conda

我已经在Windows 10上使用anaconda 64位python v3.6相当一段时间了,但是直到最近才发现conda-forge。我发现在conda-forge上实际上有很多使用pip安装的python软件包。

我想用conda-forge软件包替换pip软件包。我一直在手动执行此操作,但是这太麻烦了,因为它们有很多pip包。有没有简单的方法可以通过一个命令行自动用conda-forge软件包替换pip软件包?我愿意使用任何其他方便的方法来代替手动进行操作。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

除了一些bash骇客之外,没有惯用的方法来解决此问题:

一个问题是conda的存储库可能不那么全面,并且没有涵盖所有版​​本。假设所有版本都可以使用,下面是一个简单的脚本:

conda install $(pip freeze | sed 's/==/=/g')

因为pip要求==固定版本,而conda要求=,所以只需sed输入的格式必须正确。

如果它不起作用,则必须使用风险更大的方法:

(sandbox) ❯ for pkg in $(pip freeze | sed 's/==/=/g'); do conda install -y $pkg; done

我什至制作了一个沙盒conda环境,以防我弄乱了python。这样会安装您在pip中拥有的所有内容,如果失败(即conda仓库中不存在相应的版本),则它会继续静默安装下一个软件包。

请注意,这具有很高的风险,您绝对应该检查安装的内容以及之后没有安装的内容。

答案 1 :(得分:2)

首先,我建议您创建环境并在其中安装库。这样,您的“基本”环境将保持干净,您可以随时恢复到原来的状态。如果这样做,则解决方法很容易:删除具有许多pip库的环境,并创建一个重新开始的新环境。 https://conda.io/docs/user-guide/tasks/manage-environments.html在此处说明了Conda环境。

也就是说,如果您想用conda-forge中的库自动替换已安装的pip库,则可以使用以下命令来完成。我在bash终端上进行了实验,但我想可以在Anaconda提示符或命令提示符下进行类似的操作。

但是通过命令执行这种操作可能会破坏您的环境。为了保持当前环境的安全,您应该通过以下方式保存信息:

conda env export > environment.yml

对于实验,创建一个仅安装pip的测试环境。

conda create -y -n testenv pip
source activate testenv

然后通过pip安装两个库,tqdm(在conda-forge上可用)和janome(在conda云上不可用)。

pip install tqdm janome

我的环境现在如下所示。

conda list

## Name                    Version                   Build  Channel
ca-certificates           2018.03.07                    0  
certifi                   2018.8.13                py37_0  
Janome                    0.3.6                     <pip>
libedit                   3.1.20170329         h6b74fdf_2  
libffi                    3.2.1                hd88cf55_4  
libgcc-ng                 8.2.0                hdf63c60_1  
libstdcxx-ng              8.2.0                hdf63c60_1  
ncurses                   6.1                  hf484d3e_0  
openssl                   1.0.2p               h14c3975_0  
pip                       10.0.1                   py37_0  
python                    3.7.0                hc3d631a_0  
readline                  7.0                  ha6073c6_4  
setuptools                40.0.0                   py37_0  
sqlite                    3.24.0               h84994c4_0  
tk                        8.6.7                hc745277_3  
tqdm                      4.25.0                    <pip>
wheel                     0.31.1                   py37_0  
xz                        5.2.4                h14c3975_4  
zlib                      1.2.11               ha838bed_2  

现在,我们要执行以下操作: 对于通过pip安装的每个库(如果位于conda-forge上,请安装并从pip卸载该库。

这是执行此操作的命令...

for lib in `conda list | grep '<pip>' | cut -f 1 -d ' '`; \
do 
  echo "*****checking $lib*****"; \
  conda install -y -c conda-forge $lib && \
  pip uninstall -y $lib; \
done
  • 第1行:收集通过pip安装的库。
  • 第4行:从conda-forge安装相同的库。
  • 第5行:如果是从conda-forge安装的,请卸载一个点子。

现在我的环境如下所示。

conda list

# Name                    Version                   Build  Channel
ca-certificates           2018.8.13            ha4d7672_0    conda-forge
certifi                   2018.4.16                py37_0    conda-forge
Janome                    0.3.6                     <pip>
libedit                   3.1.20170329         h6b74fdf_2  
libffi                    3.2.1                hd88cf55_4  
libgcc-ng                 8.2.0                hdf63c60_1  
libstdcxx-ng              8.2.0                hdf63c60_1  
ncurses                   6.1                  hf484d3e_0  
openssl                   1.0.2o               h470a237_1    conda-forge
pip                       10.0.1                   py37_0  
python                    3.7.0                hc3d631a_0  
readline                  7.0                  ha6073c6_4  
setuptools                40.0.0                   py37_0  
sqlite                    3.24.0               h84994c4_0  
tk                        8.6.7                hc745277_3  
tqdm                      4.24.0                     py_1    conda-forge
wheel                     0.31.1                   py37_0  
xz                        5.2.4                h14c3975_4  
zlib                      1.2.11               ha838bed_2