python numpy（v1.15.0）无法容纳抛物线

Question

我很难理解为什么numpy很难将抛物线拟合到这些数据上？

def make_poly(x, coefs):
    # generate a polynomial from an array of coefficients
    f = numpy.zeros(len(x))
    for i in range(len(coefs)):
        f = f + coefs[-1-i]*x**i
    return(f)


xx = [1443.56, 1443.56, 1450.83, 1447.59, 1454.9, 1434.77, 1423.74, 1426.87, 1438.75, 1447.59, 1454.9, 1444.36, 1454.9, 1426.09, 1454.08, 1453.27, 1447.59, 1449.2, 1451.64, 1454.08, 1454.08, 1454.9, 1454.9, 1455.71, 1452.45, 1450.01, 1453.27, 1430.81, 1454.9, 1448.39, 1432.39, 1452.45, 1445.16, 1431.6, 1447.59, 1447.59, 1425.3, 1443.56, 1453.27, 1424.52, 1429.23, 1421.4, 1454.08, 1445.97, 1427.66, 1429.23, 1433.18, 1430.81, 1440.35,1429.23]

yy = [120.15, 120.15, 123.09, 122.07, 123.52, 116.35, 104.75, 108.34, 119.13, 122.07, 124.27, 120.29, 124.27, 106.6, 124.27, 124.13, 122.07, 122.2,  122.34, 123.37, 124.27, 124.27, 124.27, 124.41, 122.34, 122.2,  123.24, 111.95, 124.27, 121.31, 113.71, 123.24, 121.18, 113.71, 121.31, 122.07, 106.6,  121.04, 124.13, 105.61, 110.96, 100.31, 123.37, 121.18, 109.21, 111.83, 114.58, 112.83, 118.38, 110.96]

fit_result = numpy.polyfit(x=xx, y=yy, deg=2, full=True)
newX = numpy.linspace(1420, 1460, 100)
pyplot.scatter(xx, yy)
pyplot.plot(newX, make_poly(newX, fit_result[0]), 'g', linewidth =.5)
pyplot.show()

运行此操作还会引发消息：

Python(35100,0x7fff9cda3380) malloc: *** mach_vm_map(size=18446744072151506944) failed (error code=3)
*** error: can't allocate region
*** set a breakpoint in malloc_error_break to debug
init_dgelsd failed init

我正在OS High Sierra，Python 3.7.0，numpy 1.15.0（使用自制软件安装）上运行此文件。

Answer 1

该示例中提供的代码效果很好。 因此，我想问题出在包版本状态。 要解决该错误，您必须确保Wheel，setuptools和pip +您使用的软件包是最新的。为此，请使用以下命令：

pip install --upgrade pip setuptools wheel
pip install -I numpy matplotlib # + Other packages.

完成安装后，重试。如果错误仍然存​​在，请使用您正在使用的python版本和软件包扩展问题（以便可以重现）。

更新：

以上答案已解决了该问题，尤其是将numpy从1.15.0升级到1.15.1

Answer 2

在Google上搜索init_dgelsd会显示以下错误报告：py-numpy: numpy.polyfit broken with +gfortran variant on High Sierra。

您可以运行

import numpy
numpy.test('full')

...运行NumPy的内置测试套件，看看它是否返回任何问题。

Mojca Miklavec suggests：

  

显然是

     

sudo port install py37-numpy +gcc7

     

或

     

sudo port install py37-numpy +gcc8

     

解决了该问题，但是在盲目更改默认值之前找出原因的理想选择。

Answer 3

您的代码对我而言就像是一个魅力，它产生以下输出（Version:3.6.1 |Anaconda 4.4.0 (x86_64)。顺便说一句，您不需要附加函数make_poly即可创建多项式。NumPy为您提供了poly1d。以下没有make_poly的缩短代码的工作方式相同：

fit_result = np.polyfit(xx, yy, 2)
fit_eq = np.poly1d(fit_result)
newX = np.linspace(1420, 1460, 100)
plt.scatter(xx, yy)
plt.plot(newX, fit_eq(newX), 'g', linewidth =.5)