Question

从一个月以来，我一直在使用《用R进行深度学习》这本书，它使我得以建立自己的第一个神经网络。我正在使用Ubuntu。直到两天前，一切都还不错，并且工作正常。但是两天前，我将Ubuntu升级到Ubuntu 18.02。从那时起，我的R代码不再起作用。

我已经重做了书中推荐的内容（以及一个月前有效的内容）： $ sudo apt-get更新

$ sudo apt-get upgrade

$ sudo apt-get install python-pip python-dev

$ sudo apt-get install build-essential cmake git unzip pkg-config libopenblas-dev liblapack-dev

我没有错误。

然后在R中

install.packages("keras")
library(keras)
install_keras()

最后一条命令应该使用TensorFlow在Python虚拟环境中安装核心Keras库及其依赖项。

但是我得到了我真正不理解的以下错误：

> install_keras()
Using existing virtualenv at  ~/.virtualenvs/r-tensorflow 
Upgrading pip ...
Traceback (most recent call last):
File "/home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/pip", line 7, in <module>
   from pip._internal import main
File "/home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/local/lib/python2.7/site-packages/pip/_internal/__init__.py", line 5, in <module>
   import logging
File "/usr/lib/python2.7/logging/__init__.py", line 26, in <module>
   import sys, os, time, cStringIO, traceback, warnings, weakref, collections
 File "/usr/lib/python2.7/weakref.py", line 14, in <module>
    from _weakref import (
ImportError: cannot import name _remove_dead_weakref
Erreur : Error 1 occurred installing TensorFlow

我已经重新安装了R，python，tensorflow，但是我总是遇到相同的错误。我不明白这个错误。也许这是virtualenv的问题？

有人可以帮我吗？真令人沮丧，因为两天前我的代码正在运行，现在无法工作...

我正在使用Ubuntu 18.02，安装的版本是python 2.7.15〜rc1-1，R-3.4.4和tensorflow-1.10.0。

Answer 1

非常感谢this post。我真的不明白这篇文章中的命令应该解决什么。但是我已经做了以下事情：

cd /home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/

然后，按照帖子中的建议：

virtualenv . --system-site-packages

我获得了以下消息：

Running virtualenv with interpreter /usr/bin/python2
New python executable in /home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/python2
Not overwriting existing python script /home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/python (you must use /home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/python2)
Traceback (most recent call last):
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 2375, in <module>
      main()
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 724, in main
      symlink=options.symlink)
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 946, in create_environment
      site_packages=site_packages, clear=clear, symlink=symlink))
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 1417, in install_python
      os.symlink(py_executable_base, full_pth)
OSError: [Errno 17] File exists

我也尝试过：

virtualenv -p /usr/bin/python2.7 .

我得到了：

Running virtualenv with interpreter /usr/bin/python2.7
New python executable in /home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/python2.7
Traceback (most recent call last):
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 2375, in <module>
      main()
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 724, in main
      symlink=options.symlink)
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 946, in create_environment
      site_packages=site_packages, clear=clear, symlink=symlink))
   File "/usr/lib/python3/dist-packages/virtualenv.py", line 1278, in install_python
      shutil.copyfile(executable, py_executable)
   File "/usr/lib/python2.7/shutil.py", line 97, in copyfile
      with open(dst, 'wb') as fdst:
IOError: [Errno 40] Too many levels of symbolic links: '/home/baragatt/.virtualenvs/r-tensorflow/bin/python2.7'

Answer 2

我通过查看不同的论坛终于找到了解决方案。我认为问题应该是由于在R中执行以下命令时应创建的虚拟环境。

install_keras()

因此，我通过删除这些环境所在的目录来删除了虚拟环境（我想）。

cd ~/.virtualenvs
rm -r r-tensorflow/

然后我在R中尝试了以下命令

install.packages（“ keras”）图书馆（keras） install_keras（）

它有效！老实说，我仍然不了解Ubuntu更新后发生了什么问题。

自Ubuntu更新以来R中的install_keras（）错误

2 个答案: