使用子进程从Python运行bash命令时出现问题

时间:2018-08-21 11:06:46

标签: python bash subprocess pdal

问题:

我无法使用pdal从Python运行subprocess bash命令。

这是代码

基于Running Bash commands in Python

import os, subprocess

input = '/path/to/file.ply'
output = '/path/to/statfile.json'
if not os.path.isfile(output):
    open(output, 'a').close()

bashcmd = ("pdal info --boundary "
           +input
           +" > "
           +output
           )

print("Bash command is:\n{}\n".format(bashcmd))

process = subprocess.Popen(bashcommand.split(),
                           stdout=subprocess.PIPE,
                           shell=True)
    output, error = process.communicate()
    print("Output:\n{}\n".format(output))
    print("Error:\n{}\n".format(error))

哪个在Python控制台中给了我以下输出:

Bash command is:
pdal info --boundary /path/to/file.ply > /path/to/statfile.json

Output:
Usage:
  pdal <options>
  pdal <command> <command options>
  --command        The PDAL command
  --debug          Sets the output level to 3 (option deprecated)
  --verbose, -v    Sets the output level (0-8)
  --drivers        List available drivers
  --help, -h       Display help text
  --list-commands  List available commands
  --version        Show program version
  --options        Show options for specified driver (or 'all')
  --log            Log filename (accepts stderr, stdout, stdlog, devnull as
      special cases)
  --logtiming      Turn on timing for log messages

The following commands are available:
  - delta
  - diff
  - fauxplugin
  - ground
  - hausdorff
  - info
  - merge
  - pcl
  - pipeline
  - random
  - smooth
  - sort
  - split
  - tindex
  - translate

See http://pdal.io/apps/ for more detail

Error:
None

似乎只有在调用“ pdal”之后,它才停止读取命令的参数,这会打印此帮助消息。

如果我复制第一张照片的输出并将其粘贴到bash终端中,它将正常工作,并为我提供具有所需元数据的输出文件。但是从Python不会创建任何输出文件。

问题:

我想知道为什么(例如,重定向是否有问题,或者计算本身通常可能需要20秒左右的时间?),以及如何从Python执行此命令?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这里有多个错误。

  • 您使用的是未定义变量bashCommand,而不是您在bashcmd上方定义的变量。
  • 您正在使用shell重定向将输出混合到Python文件句柄。
  • 您没有捕获过程的stderr。 (我会模糊地假设您仍然不需要标准错误。)
  • 如果您使用split()运行该命令,则不应shell=True

更广泛地讲,您应该避免使用shell=True并让Python通过将输出连接到您打开的文件来为您处理重定向。并且在现代,如果可以使用subprocess.Popen()subprocess.run()或朋友,则实际上不应该使用subprocess.check_call()

import subprocess

input = '/path/to/file.ply'
output = '/path/to/statfile.json'

with open(output, 'a') as handle:
    bashcmd = ['pdal', 'info', '--boundary', input]

    #print("Bash command is:\n{}\n".format(bashcmd))

    result = subprocess.run(bashcmd, stdout=handle, stderr=subprocess.PIPE)

    # No can do because output goes straight to the file now
    ##print("Output:\n{}\n".format(output))
    #print("Error:\n{}\n".format(result.stdout))