使用在同一目录中存储的多个exe文件的软件该怎么办

Question

我正在键入一种使用以另一种语言编程的.exe文件的软件。该软件位于C#中，.exe文件位于C++中。
有什么办法可以将这些独立的.exe文件更改为任何给定用户都无法执行但仍可以被我的C#程序使用的文件？

如果这不可行，那么是否可以构建将多种语言集成到一个执行程序中的项目/解决方案？