如何在dplyr中将列矩阵附加到数据帧?

时间:2018-08-20 18:59:00

标签: r matrix dplyr

我想将(mutate)多列附加到数据帧中,这些列存储在矩阵中。有没有办法使用tidyverse的功能来做到这一点? (但是请注意,可以通过使用base::函数来实现。)同样,我要问的是使用tidyverse中的函数执行此操作的最自然(惯用的)方法是什么。

例如,假设我们估计了分位数回归:

library(dplyr)

tibble(x = runif(100)) %>%
  mutate(y = rnorm(n())) ->
  EstimationData

library(quantreg)

taus <- (1:9)/10
rq_fit <- rq(y ~ x, tau = taus, data = EstimationData)

,我们希望根据以下x值来预测模型:

PredictionData <- tibble(x = seq(0, 1, len = 10))

这可以通过以下方式完成:

predict(rq_fit, newdata = PredictionData)

返回一个矩阵(每个tau对应一列)。很自然的做法是将预测连同它们对应的x打包在一起。可能希望能够将上述矩阵mutate() PredictionData上,但是据我所知这是不可能的。一种可能是:

PredictionData %>%
  data.frame(predict(rq_fit, newdata = .), check.names = FALSE) # (*)

效果很好(特别是因为矩阵列具有名称),尽管它依赖base::data.frame()。请注意,tibble()as_tibble()不起作用。

尝试编写更多惯用的tidyverse代码的一种方法是将矩阵变成向量列表,如下所示:

row_split <- function(X) split(X, row(X, as.factor = TRUE))

PredictionData %>%
  mutate(y = row_split(predict(rq_fit, newdata = .))) %>%
  unnest(.id = 'tau_ix') %>%
  mutate(tau = taus[as.integer(tau_ix)]) %>%
  select(-tau_ix)

但是我不认为这会更好。

方法(*)是最好的方法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我认为您想要的功能是dplyr::bind_cols()。请注意,这不适用于矩阵,因此您还必须使用dplyr::as_tibble()

如果您的目标是保持小标题,使用dplyr等中的函数,那么我认为这是最简单的方法:

PredictionData %>% bind_cols(as_tibble(predict(rq_fit, newdata = .)))

但是,人们可能会认为这有点“从内而外”,而不是“从左到右”,以至于对于dplyr方法来说,这确实是惯用的。所以,也许您想要更多类似的东西

rq_fit %>%
    predict(newdata = PredictionData) %>%
    as_tibble() %>%
    bind_cols(PredictionData) %>%
    select(x, everything())

两种方法都提供以下输出:

# A tibble: 10 x 10
           x `tau= 0.1` `tau= 0.2` `tau= 0.3` `tau= 0.4`   `tau= 0.5` `tau= 0.6` `tau= 0.7` `tau= 0.8` `tau= 0.9`
       <dbl>      <dbl>      <dbl>      <dbl>      <dbl>        <dbl>      <dbl>      <dbl>      <dbl>      <dbl>
 1 0.0000000 -1.5755585 -0.8082654 -0.3133431 -0.1952309  0.058074887 0.44450275  0.6679990  0.8802325   1.650510
 2 0.1111111 -1.4767907 -0.7915847 -0.3517192 -0.1909820  0.041473996 0.39935461  0.6132367  0.8618259   1.618999
 3 0.2222222 -1.3780228 -0.7749040 -0.3900952 -0.1867331  0.024873104 0.35420647  0.5584744  0.8434194   1.587488
 4 0.3333333 -1.2792549 -0.7582233 -0.4284712 -0.1824842  0.008272213 0.30905833  0.5037121  0.8250128   1.555976
 5 0.4444444 -1.1804871 -0.7415425 -0.4668472 -0.1782353 -0.008328679 0.26391019  0.4489498  0.8066063   1.524465
 6 0.5555556 -1.0817192 -0.7248618 -0.5052233 -0.1739865 -0.024929570 0.21876205  0.3941875  0.7881997   1.492954
 7 0.6666667 -0.9829513 -0.7081811 -0.5435993 -0.1697376 -0.041530462 0.17361391  0.3394252  0.7697932   1.461442
 8 0.7777778 -0.8841835 -0.6915004 -0.5819753 -0.1654887 -0.058131353 0.12846577  0.2846630  0.7513866   1.429931
 9 0.8888889 -0.7854156 -0.6748196 -0.6203513 -0.1612398 -0.074732245 0.08331763  0.2299007  0.7329801   1.398419
10 1.0000000 -0.6866477 -0.6581389 -0.6587274 -0.1569909 -0.091333136 0.03816949  0.1751384  0.7145735   1.366908

数据

为了可重复性,我使用您的代码创建了数据,但首先设置了种子:

set.seed(1234)

library(dplyr)

tibble(x = runif(100)) %>%
    mutate(y = rnorm(n())) ->
    EstimationData

library(quantreg)

taus <- (1:9)/10
rq_fit <- rq(y ~ x, tau = taus, data = EstimationData)

PredictionData <- tibble(x = seq(0, 1, len = 10))