Question

我正在尝试编写一段代码，该代码将递归地遍历特定目录的子目录，并且仅在到达扩展名为'.nii'的文件时才停止，并将这些文件附加到名为images的列表中。广度优先搜索。但是，无论何时运行此代码，我都会不断收到[Errno 20]而不是目录：'/Volumes/ARLO/ADNI/.DS_Store'

* / Volumes / ARLO / ADNI是我要遍历的文件夹

*我正在Mac中使用Anaconda的Spyder IDE进行此操作，因为这是我可以使用numpy和nibabel库的唯一方法，这将在以后变得很重要

*我已经检查过该文件夹直接包含其他文件夹而不包含文件

#preprocessing all the MCIc files
import os
#import nibabel as nib
#import numpy as np

def pwd():
    cmd = 'pwd'
    os.system(cmd)
    print(os.getcwd())

#Part 1
os.chdir('/Volumes/ARLO')
images = [] #creating an empty list to store MRI images
os.chdir('/Volumes/ARLO/ADNI')
list_sample = [] #just an empty list for an earlier version of 
#the program

#Part 2
#function to recursively iterate through folder of raw MRI 
#images and extract them into a list
#breadth first search
def extract(dir):
    #dir = dir.replace('.DS_Store', '')
    lyst = os.listdir(dir) #DS issue
    for item in lyst:
        if 'nii' not in item: #if item is not a .nii file, if 
#item is another folder
            newpath = dir + '/' + item
            #os.chdir(newpath) #DS issue
            extract(newpath)
        else: #if item is the desired file type, append it to 
#the list images
            images.append(item)

#Part 3           
adni = os.getcwd() #big folder I want to traverse
#print(adni) #adni is a string containing the path to the ADNI 
#folder w/ all the images
#print(os.listdir(adni)) this also works, prints the actual list
"""adni = adni + '/' + '005_S_0222' 
os.chdir(adni)
print(os.listdir(adni))""" #one iteration of the recursion, 
#works
extract(adni)
print(images)

对于每次迭代，我希望通过将文件夹名称附加到增长路径来进一步遍历嵌套文件夹，并且代码的第3部分有效，即，我知道一个迭代即可。为什么os继续在extract()函数中将'.DS_Store'部分添加到我的目录中？如何纠正我的代码，以便可以进行广度优先遍历？该文件夹包含数百张MRI图像，没有自动化我将无法做到。

谢谢。

Answer 1

.DS_Store文件不是由os模块创建的，而是由Finder（或者，我认为有时是Spotlight）创建的。它们是macOS存储系统上每个目录的视图选项和图标布局之类的地方。

他们可能一直在那里。当您查看时没有看到它们的原因是，以.开头的文件在Unix（包括macOS）上被“隐藏”。 Finder不会显示它们，除非您要求它显示隐藏文件。除非您通过ls标志，否则-a不会显示它们；等

所以，这是您的核心问题：

我已经检查过该文件夹直接包含其他文件夹而不包含文件

...是错误的。文件夹确实包含至少一个常规文件。 .DS_Store。

那么，您能做什么？

您可以为.DS_Store添加特殊处理。

但是更好的解决方案可能是通过调用每个文件os.path.isdir来检查每个文件是否是文件或目录。

或者，甚至更好的是，使用os.scandir代替listdir，这为您提供的条目不仅包含名称，还包含更多信息，因此您无需像isdir那样进行额外的呼叫

或者，最重要的是，只需抛出这段代码并使用os.walk来递归访问顶级目录下每个目录中的每个文件。

处理操作系统错误Python：[Errno 20]不是目录：'/Volumes/ARLO/ADNI/.DS_Store'

1 个答案: