Question

sed的新手，试图完成以下操作，但完全卡住了：我正在尝试在第二列中用sed替换模式。此模式发生了多次。

我有：

Gene1 GO:0000045^biological_process^autophagosome assembly`GO:0005737^cellular_component^cytoplasm
Gene2 GO:0000030^molecular_function^mannosyltransferase activity`GO:0006493^biological_process^protein O-linked glycosylation`GO:0016020^cellular_component^membrane

我想得到：

Gene1 GO:0000045,GO:0005737
Gene2 GO:0000030,GO:0006493,GO:0016020

因此，请删除所有描述性部分，并使用“，”作为分隔符。我选择使用sed是因为我认为可以轻松识别^和`之间的模式。但是，它会删除所有第一个GO条款。

代码：

sed -E 's/(^)'.+'(`)/,/g'

有人可以帮我吗？

Answer 1

尝试一下，显示为两个步骤

$ # showing how to remove from ^ to ` and replace with ,
$ sed 's/\^[^`]*`/,/g' ip.txt
Gene1 GO:0000045,GO:0005737^cellular_component^cytoplasm
Gene2 GO:0000030,GO:0006493,GO:0016020^cellular_component^membrane

$ # removing remaining data from ^ to end of line as well
$ sed 's/\^[^`]*`/,/g; s/\^.*//' ip.txt
Gene1 GO:0000045,GO:0005737
Gene2 GO:0000030,GO:0006493,GO:0016020

由于^是一个元字符，请使用\^从字面上进行匹配
[^`]*将匹配零个或多个非`字符
请勿使用\^.*`，由于greedy nature of quantifiers，这将从行的第一个^删除到最后一个反引号

Answer 2

sed -e 's/\^[^`]*//g' -e 's/`/,/g' your_file

第一个命令删除（除以`之后^之后的任何字符（不包括任何字符）

用`替换,

Answer 3

识别单个字段，然后对每个字段进行操作，可能比仅使用正则表达式识别每一行的部分更为有用：

    public interface IScheduleClientContract
    {
        void UpdateToCheckedIn(string id);

    }

    [Fact]
    public void UpdateToCheckedIn_Should_Broadcast_Id()
    {
        var hub = new ScheduleHub();
        var clients = new Mock<IHubCallerConnectionContext<dynamic>>();
        var all = new Mock<IScheduleClientContract>();
        hub.Clients = clients.Object;
        all.Setup(m=>m.UpdateToCheckedIn(It.IsAny<string>())).Verifiable();
        clients.Setup(m => m.All).Returns(all.Object);

        hub.UpdateToCheckedIn("id");

        all.VerifyAll();

    }

。

$ awk -F'^' -v OFS=',' '{print NR") "$0; for (i=1;i<=NF;i++) print "\t"i") "$i}' file
1) Gene1 GO:0000045^biological_process^autophagosome assembly`GO:0005737^cellular_component^cytoplasm
        1) Gene1 GO:0000045
        2) biological_process
        3) autophagosome assembly`GO:0005737
        4) cellular_component
        5) cytoplasm
2) Gene2 GO:0000030^molecular_function^mannosyltransferase activity`GO:0006493^biological_process^protein O-linked glycosylation`GO:0016020^cellular_component^membrane
        1) Gene2 GO:0000030
        2) molecular_function
        3) mannosyltransferase activity`GO:0006493
        4) biological_process
        5) protein O-linked glycosylation`GO:0016020
        6) cellular_component
        7) membrane

sed多次替换第二列中的模式

3 个答案: