基于列名称的子集列

Question

我有一个ID为df1的

df1 <- read.table(text="ID
8765
                    1879
                    8706
                    1872
                    0178
                    0268
                    0270
                    0269
                    0061
                    0271", header=T)

第二个df2，列名

> names(df2)
 [1] "TW_3784.IT"   "TW_3970.IT"   "TW_1879.IT"   "TW_0178.IT"   "SF_0271.IT" "TW_3782.IT"  
 [7] "TW_3783.IT"   "TW_8765.IT"   "TW_8706.IT"   "SF_0268.IT" "SF_0270.IT" "SF_0269.IT"
[13] "SF_0061.IT"

我需要的是仅保留df2中与df1部分匹配的列

代码

使用dplyr

df3 = df2 %>% 
  dplyr::select(df2 , dplyr::contains(df1$ID))
error

Error in dplyr::contains(df1$ID) : is_string(match) is not TRUE

使用grepl

df3 = df2[,grepl(df1$ID, names(df2))]

error
In grepl(df1$ID, names(df2)) :
  argument 'pattern' has length > 1 and only the first element will be used

Answer 1

由于列名中有清晰的图案，因此可以使用substr提取每个4位ID。将其转换为数字以删除前导零。使用which标识要保留的列号。

df2 <- c("TW_3784.IT", "TW_3970.IT", "TW_1879.IT", "TW_0178.IT", "SF_0271.IT", "TW_3782.IT")

numbers <- which(as.numeric(substr(df2, 4, 7)) %in% df1[,1])

接下来，您可以使用以下列号来子集数据框：df[,numbers]。

Answer 2

这是使用dplyr软件包的解决方案。

df2 %>% select(matches(paste(df1$ID, collapse = "|")))

这会将ID中的df1与|作为分隔符（意思是逻辑OR）粘贴在一起，如下所示：

"8765|1879|8706|1872|178|268|270|269|61|271"

这是必需的，因为matches然后查找与这些数字中的一个或另一个匹配的列名称，然后对这些列进行select运算。 dplyr，select和matches都需要%>%。

Answer 3

在df1中，您的“文本”列为整数类型。

str(df1)
'data.frame':   10 obs. of  1 variable:
 $ ID: int  8765 1879 8706 1872 178 268 270 269 61 271

转换为字符串，is_string（）应该返回true。

b6$ID <- as.character(b6$ID)