如何使用GROUP_CONCAT动态旋转和生成串联的列名

时间:2018-08-14 08:36:48

标签: mysql pivot group-concat

我有一张表格,该表格针对感染了不同病毒的不同细胞系中的化合物具有抗病毒活性,如下所示:

ID  Batch_ID    Cell_Line   Virus   Conc    Effect
1   abc123      U87         ZIKV    5       67
2   abc123      SW13        HAZV    10      35
3   def456      U87         ZIKV    5       85
4   def456      SW13        HAZV    10      15

我想将其转换为如下所示的视图:

ID  Batch_ID    U87_ZIKV_5  SW13_HAZV_10
1   abc123      67          35
2   def456      85          15

因此基本上是一种枢轴,它通过动态串联Cell_Line,Virus和Conc的原始行值来生成新的列和相应的名称,然后报告每种化合物的效果。对于有限数量的组合,这当然可以是“硬编码”的,但是我想允许以后添加其他细胞系,病毒株和浓度的可能性,因此可以动态生成透视列名称

感谢任何有关如何在mySQL中进行有效编码的指针!

1 个答案:

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因此,为表提供硬编码的解决方案非常简单:

select Batch_ID,
  SUM(CASE WHEN CONCAT(Cell_Line,'_',Virus,'_',CONVERT(Conc,CHAR))= 'U87_ZIKV_5' THEN Effect END) U87_ZIKV_5,
  SUM(CASE WHEN CONCAT(Cell_Line,'_',Virus,'_',CONVERT(Conc,CHAR)) = 'SW13_HAZV_10' THEN Effect END) SW13_HAZV_10
from viruses
group by Batch_ID;

但是,如果要使其灵活,则应使用称为动态数据透视表的东西。我使用了讨论的方法here,并提出了可以解决您问题的MySQL代码:

SET @sql = NULL;
SELECT
  GROUP_CONCAT(DISTINCT
    CONCAT(
      'SUM(CASE WHEN CONCAT(Cell_Line,\'_\',Virus,\'_\',CONVERT(Conc,CHAR)) =  ''',
      CONCAT(Cell_Line,'_',Virus,'_',CONVERT(Conc,CHAR)),
      ''' THEN Effect END) AS ',
      CONCAT(Cell_Line,'_',Virus,'_',CONVERT(Conc,CHAR))
    )
  ) INTO @sql
from viruses;

SET @sql = CONCAT('SELECT Batch_ID, ', @sql, ' from viruses
group by Batch_ID');

PREPARE stmt FROM @sql;
EXECUTE stmt;
DEALLOCATE PREPARE stmt;