我使用git-new-workdir来分隔我的工作区域（Git版本为2.1.2，git-worktree不可用）。我保留了存储库的一个克隆副本（我知道工作目录通过符号链接指向）。随着时间的流逝，我从未自发接触过的随机文件会分阶段出现在克隆目录中（我不必为此而碰触），有时还会出现在关联的工作目录中。出现许多这样的文件，并且它们总是处于暂存状态（这些文件是合法的存储库对象，即它们不是完全随机的垃圾）。除了通常我所关心的工作目录不受影响外，我一直找不到韵律或原因。它似乎只会影响我不经常使用的目录。这已经持续了几个月。
工作顺序示例：
git clone的存储库（做过一次）–称为“ repo” git-new-workdir repo TICKET； cd TICKET; git fetch; git
co branch git status；出现了一堆暂存文件，包括新的，已修改的和已删除的文件，这些文件与我在任何地方所做的任何操作完全无关（再次，不是垃圾，但它们似乎是对合法回购对象的实际更改，以某种方式传播到了我的工作目录） 。尽管看起来与合并中看到的内容相似，但未显示任何合并。看来我已经修改了回购文件并完成了git add，但我还没有。这种情况发生时，我有点卡住；要么我不理会它，因为担心“修复”它会破坏某些东西，或者我删除整个目录，然后重新启动（如果它是一个工作目录）。
我唯一的理论是，如果我删除未经许可使用的工作目录，也许git不喜欢它。但是我看不到git-del-workdir命令。
任何将其隔离开来的提示或使情况变得清晰的想法将不胜感激；到目前为止，我还没有提出任何想法。虽然我已经使用git几年了，但是我对git的了解还是很狭窄的。我确实看到git-new-workdir已被git worktree取代；这是原因之一吗？
尽管我尝试搜索SO或Internet，但很难，因为很难为症状找到有效的关键字。我意识到我的写作有点想要，但是很难在小范围内复制这个问题，因为这将需要创建我自己没有能力做的自己的仓库（并且还需要投入大量可能徒劳的时间和精力） ）。
环境是rhel6 AWS。
编辑：我确定在受影响的目录中，差异似乎是最近签入的内容的逆转，大概是因为我上次对workdir进行了处理。已添加的文件显示为已删除，已删除的文件显示为已添加，并且已修改的文件被反转。这与某些索引变得混乱的理论是一致的。
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