Question

我使用MPI_Barrier的OpenMPI实现有一些同步问题：

int rank;
int nprocs;

int rc = MPI_Init(&argc, &argv);

if(rc != MPI_SUCCESS) {
    fprintf(stderr, "Unable to set up MPI");
    MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, rc);
}

MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &nprocs);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);


printf("P%d\n", rank);
fflush(stdout);

MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

printf("P%d again\n", rank);

MPI_Finalize();

对于mpirun -n 2 ./a.out

输出应该是： P0 P1 ......

输出有时： P0 再次P0 P1 P1再次

发生了什么事？

Answer 1

打印输出行在终端上显示的顺序不一定是打印内容的顺序。您正在使用共享资源（stdout），因此始终存在排序问题。（fflush在这里没有用，stdout无论如何都是行缓冲。）

您可以尝试使用时间戳为输出添加前缀，并将所有这些保存到不同的文件中，每个MPI进程一个。

然后，要检查日志，您可以将两个文件合并在一起，并根据时间戳进行排序。

那么你的问题就会消失。

Answer 2

MPI_Barrier（）没有错。

作为Jens mentioned，您没有看到预期输出的原因是因为stdout在每个进程上都被缓冲。无法保证来自多个进程的打印将按顺序显示在调用进程中。（如果每个进程的stdout被转移到主进程实时打印，那将导致大量不必要的通信！）

如果您想说服自己屏障有效，可以尝试写入文件。将多个进程写入单个文件可能会导致额外的复杂化，因此您可以将每个proc写入一个文件，然后在屏障之后交换他们写入的文件。例如：

    Proc-0           Proc-1
      |                 |
 f0.write(..)     f1.write(...) 
      |                 |
      x  ~~ barrier ~~  x
      |                 |
 f1.write(..)     f0.write(...) 
      |                 |
     END               END

示例实施：

#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char **argv) {
    char filename[20];
    int rank, size;
    FILE *fp;

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

    if (rank < 2) { /* proc 0 and 1 only */ 
        sprintf(filename, "file_%d.out", rank);
        fp = fopen(filename, "w");
        fprintf(fp, "P%d: before Barrier\n", rank);
        fclose(fp);
    }

    MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

    if (rank < 2) { /* proc 0 and 1 only */ 
        sprintf(filename, "file_%d.out", (rank==0)?1:0 );
        fp = fopen(filename, "a");
        fprintf(fp, "P%d: after Barrier\n", rank);
        fclose(fp);
    }

    MPI_Finalize();
    return 0;

}

运行代码后，您应该得到以下结果：

[me@home]$ cat file_0.out
P0: before Barrier
P1: after Barrier

[me@home]$ cat file_1.out
P1: before Barrier
P0: after Barrier

对于所有文件，“后障碍”语句将始终显示在以后。

Answer 3

MPI程序无法保证输出顺序。

这与MPI_Barrier完全没有关系。

另外，我不会花太多时间来担心MPI程序的输出排序。

实现这一目标的最优雅的方法，如果你真的想要，就是让进程将他们的消息发送到一个等级，比如排名0，让等级0按照它接收或排序的顺序打印输出。行列。

同样，不要花太多时间尝试从MPI程序订购输出。这是不实际的，没什么用处。

Answer 4

在此处添加以前的答案后，您的MPI_BARRIER可以正常工作。

尽管，如果您只是想使其运行，可以强制暂停执行（SLEEP(1)）一会儿，以使输出赶上。

OpenMPI MPI_Barrier问题

4 个答案: