将矩阵列转换为单位向量的快速方法

时间:2018-08-08 08:18:44

标签: matlab performance matrix optimization normalize

我有一个矩阵:

S = [  -1.0400    4.9100    4.1000   -3.5450   -0.6600   -0.9300    4.3950   -1.0650    2.9850   -4.9800    0.2100;
   -0.5200   -4.3150   -3.0950    0.5700    4.4700    1.1500    3.1350    0.6450    0.3750   -4.9150   -2.1150; 
    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000    5.0000 ];

我想将列转换为单位向量,所以我使用了for循环

for i=1:size(S,2)
    S(:,i) = S(:,i) / norm( S(:,i) );
end

有没有一种方法可以在MATLAB中更有效地做到这一点?

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

TLDR

如果您具有MATLAB 2016b或更高版本,并且没有兼容性问题,我将使用

S = S ./ sqrt(sum(S.^2,1));

编辑:请参阅底部的基准以了解替代产品的性能基准。


上下文

我们可以手动计算范数并按列划分。

根据定义,norm(x) = sqrt( sum( x(:).^2 ) )。我在这里使用(:)来表明norm是在整个矩阵上计算的。对我们有用的是,sum默认情况下按列工作,因此按以下方式定义按列规范:

nrm = sqrt( sum( x.^2 ) );

请注意,如果矩阵S仅具有1行,则应该使用nrm = sqrt(sum(x.^2,1))强制实施按列求和。

现在我们有几种划分方式:

  • 隐式扩展(MATLAB R2016b或更高版本)

    S = S ./ nrm;
    
  • 使用bsxfun的隐式扩展(所有MATLAB版本)

    S = bsxfun( @mrdivide, S, nrm );
    
  • 使用repmat(所有MATLAB版本)进行手动扩展

    S = S ./ repmat(nrm, size(S,1), 1);
    

如果您具有MATLAB R2017b或更高版本,并且又没有兼容性问题,则可以使用vecnorm,它可以代替手动范数计算

S = S ./ vecnorm(S, 2, 1);

基准:

自从您询问性能以来,这是测试这些不同方法速度的简单基准。具体来说,是问题中的原始循环与使用vecnorm或手动计算的隐式展开。

  • 结果(使用R2017b运行)

             size(S):  1e3*1e2  1e5*1e3  1e3*1e6    
             Looping:  0.0005   1.0186   12.7788
     Implicit manual:  0.0001   1.1236   10.4031
    Implicit vecnorm:  0.0002   0.5774    6.8058
    
  • 结论

    • 对于相对较小的数组,所有方法都非常快,我会选择代码清晰度而不是性能。
    • 如果您只想使用支持它的MATLAB版本,那么vecnorm的速度大约是大型矩阵其他方法的两倍。
    • 对于1e5*1e3阶矩阵,循环类似于隐式展开。
  • 代码

    function benchie()
        S = rand( 1e3, 1e2 )*5;
    
        f1 = @() loopingNorm(S);
        f2 = @() implicitManual(S);
        f3 = @() implicitVecnorm(S);
    
        fprintf( 'Looping: %.4f\nImplicit manual: %.4f\nImplicit vecnorm: %.4f\n', ...
                 timeit(f1), timeit(f2), timeit(f3) );
    end
    function S = loopingNorm(S)
        for ii = 1:size(S,2)
            S(:,ii) = S(:,ii) / norm( S(:,ii) );
        end
    end
    function S = implicitManual(S)
        S = S ./ sqrt(sum(S.^2,1));
    end
    function S = implicitVecnorm(S)
        S = S ./ vecnorm( S, 2, 1 );
    end