R：致命错误：为“ -e”创建临时文件失败

Question

sessionInfo()

  

R版本3.5.1（2018-07-02）平台：x86_64-apple-darwin15.6.0   （64位）运行于：macOS High Sierra 10.13.3

library(parallel)
makeCluster(detectCores() - 1)

R中的输出：

  

致命错误：为'-e'创建临时文件失败

如何解决此问题？谢谢！

Answer 1

您能否确认基于包含Seurat的示例数据的代码有效。

例如，以下工作有效吗？

library(Seurat)
res <- ScaleData(object = pbmc_small, vars.to.regress = c("nUMI"))
#Regressing out: nUMI
#  |======================================================================| 100%
#Time Elapsed:  2.64941716194153 secs
#Scaling data matrix
#  |======================================================================| 100%

Answer 2

parallel软件包似乎将tmp文件保存到/ var / tmp /。错误Fatal error: creating temporary file for '-e' failed似乎与此位置的访问问题有关。通过启用此文件夹的权限（在我的情况下，通过在Docker / Singularity映像中挂载该位置），我能够解决此问题。