我正在尝试使用等值线在泻湖环境中显示电导率的横截面。我已将stat_contour()
和cond_df <- read_csv("salinity_profile.csv")
di <- interp(cond_df$stop, cond_df$depth, cond_df$conductivity,
xo = seq(min(cond_df$stop), max(cond_df$stop), length = 200),
yo = seq(min(cond_df$depth), max(cond_df$depth), length = 200))
dat_interp <- data.frame(expand.grid(x=di$x, y=di$y), z=c(di$z))
ggplot(dat_interp) +
aes(x=x, y=y, z=z, fill=z)+
scale_y_reverse() +
geom_tile()+
stat_contour(colour="white", size=0.25) +
scale_fill_viridis_c() +
theme_tufte(base_family="Helvetica")
应用于我的数据,但是我想剪切插值输出,以使其不会超出我的数据点。这样,横截面上泻湖的水深就很清楚了。这是我到目前为止使用的代码:
geom_point()
以下是输出:
为澄清起见,这里的数据就像cond_df%>%
ggplot(mapping=aes(x=stop, y=depth, z=conductivity, fill=conductivity)) +
geom_point(aes(colour = conductivity), size = 3) +
scale_y_reverse()
图一样,我不希望插值层超过图的较低点:
contourf()
答案 0 :(得分:1)
您可以使用geom_ribbon
来遮盖绘图中不需要的区域。
您将需要生成一个data.frame
,其中包含每个停靠点的最大深度值。这是一种微不足道的方法:
# Create the empty data frame for all stops
bathymetry <- data.frame(depth = as.numeric(NA),
stop = unique(cond_df$stop))
# Find the max depth for each stop
for(thisStop in bathymetry$stop){
bathymetry[bathymetry$stop==thisStop, "depth"] <- max(cond_df[cond_df$stop==thisStop, "depth"])
}
然后,您可以将geom_ribbon
添加为情节的最后一个geom
,
geom_ribbon(data=bathymetry, aes(x=stop, ymin=depth, ymax=max(cond_df$depth)), inherit.aes = FALSE)