Python-3D切片器和从图像中检索黑白数据

Question

我必须做一个项目，在其中必须分析图像并从该图像中获取数据（白质和灰质），然后必须绘制该脑部图像的3个切片器。

现在，我已经在pycharm中安装了OpenCV，numpy和matplotlib。并且我正在使用Windows平台，请任何人帮助我完成项目。

Answer 1

要深入了解数据，可能是您可以下载程序3D Slicer（https://download.slicer.org），那么您应该能够加载图像。由于它支持多种格式（DICOM，nrrd，nifti等），因此您应该能够加载它。

然后，您可以自己“分析”，您可以利用嵌入式python解释器并访问与该卷相对应的numpy数组。

请参见https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Developers/Python_scripting#Accessing_Volume_data_as_numpy_array

它还包括一组广泛的模块，用于处理，转换，分割和注册图像。此处提供的教程应该会有所帮助：https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Training

对于您在相关论坛上的问题，http://discourse.slicer.org/

Answer 2

我用切片机进行组织分类。这不是很准确。我建议您开始使用期望最大化（EM）并为高斯定义3类组织。

如果您可以使用PMOD软件，则它具有用于脑数据分类的非常好的工具。