r脚本从终端运行缓慢

Question

最近，我为实验室编写了一个R脚本，不过

a=system(cmd, wait =T, intern = T)

成一个循环。它从终端调用一些工具。我从终端运行

sudo Rscript mycode.R。

问题在于它可以在4GB RAM，1cpu笔记本电脑中以与16GB RAM 12 CPU PC相同的速度运行。当它在PC上运行时，它仅使用1.6GB RAM和仅一个100％CPU。 PC是Ubuntu 16.04。我怎样才能使其更快？这仅仅是R施加的限制吗？预先感谢。

Answer 1

我解决了这个问题！实际上，第二条评论使我找到了解决方案。我的工作是进行一些生物信息学分析。原来，输入文件可以拆分为多个部分。我将其拆分，然后使用GNU Parallel运行并行命令。谢谢！