我有一个项目，由于使用引导程序3.3.7，因此存在一些漏洞。 See here
不幸的是，我们不能仅将项目升级到Bootstrap v4.0.0，因为它进行了太多更改，要回去修复所有这些问题将花费太多的工作。
但是，有一个分支尚未合并，可以解决这些漏洞问题。 This is the branch
我克隆了该分支，并用我项目的static文件夹中该分支中的文件替换了当前的bootstrap.js文件。不幸的是，这完全破坏了我所做的一切。诸如affix，popover之类的东西。破坏我的意思是它显示了以下消息：
未捕获的TypeError：$（...）。popover不是函数
或affix
未捕获的TypeError：$（...）。affix不是函数
我比较了格式为3.4.0和3.3.7的.js文件，据我所知，这些功能没有什么大的不同，它们会导致一切中断。例如，popover的代码就是版本。
我的问题是，也许我会以错误的方式进行尝试。处理此漏洞时还有其他事情要做吗？为什么会出现这些错误？除了.js文件之外，该分支我还需要什么才能使它正常工作？
编辑：应该注意，我正在通过Bootstrap's customization tool和config.json文件加载我的jQuery插件。这可能是问题吗？如果是这样，我如何解决该问题以使用未发布的版本？