使用addPyFiles()
似乎并没有添加想要的文件来激发作业节点(这是Spark的新增功能,因此这里可能缺少一些基本的使用知识)。
尝试使用pyspark运行脚本,并看到错误消息,指出找不到某些要导入的模块。以前从未使用过spark,但是其他帖子(来自问题https://github.com/cerndb/dist-keras/issues/36#issuecomment-378918484和https://stackoverflow.com/a/39779271/8236733的软件包)建议压缩模块并通过sparkContext.addPyFiles(mymodulefiles.zip)
添加到spark作业中,但仍然会出错。相关的代码片段是...
from distkeras.trainers import *
from distkeras.predictors import *
from distkeras.transformers import *
from distkeras.evaluators import *
from distkeras.utils import *
(在https://github.com/cerndb/dist-keras上找不到我要导入的软件包)
conf = SparkConf()
conf.set("spark.app.name", application_name)
conf.set("spark.master", master) #master='yarn-client'
conf.set("spark.executor.cores", `num_cores`)
conf.set("spark.executor.instances", `num_executors`)
conf.set("spark.locality.wait", "0")
conf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer");
if using_spark_2:
from pyspark.sql import SparkSession
sc = SparkSession.builder.config(conf=conf) \
.appName(application_name) \
.getOrCreate()
sc.sparkContext.addPyFile("/home/me/Downloads/distkeras.zip") # see https://github.com/cerndb/dist-keras/issues/36#issuecomment-378918484 and https://forums.databricks.com/answers/10207/view.html
print sc.version
(distkeras.zip是该目录的压缩文件:https://github.com/cerndb/dist-keras/tree/master/distkeras),
transformer = OneHotTransformer(output_dim=nb_classes, input_col="label_index", output_col="label")
dataset = transformer.transform(dataset)
"""throwing error...
.....
File "/opt/mapr/spark/spark-2.1.0/python/pyspark/serializers.py", line 458, in loads
return pickle.loads(obj)
ImportError: No module named distkeras.utils
at org.apache.spark.api.python.PythonRunner$$anon$1.read(PythonRDD.scala:193)
.....
"""
从我能找到的文档和示例(http://spark.apache.org/docs/2.1.0/api/python/pyspark.html#pyspark.SparkContext.addPyFile和https://forums.databricks.com/questions/10193/the-proper-way-to-add-in-dependency-py-files.html)中,上面的代码似乎应该对我有用(再次,以前从未使用过spark)。有人知道我在做什么错吗?可以发布更多对调试有用的信息吗?
答案 0 :(得分:9)
已解决问题。诚然,解决方案并不完全与火花相关,但是为了给其他可能有类似问题的人留下问题,因为给定的错误消息并没有使我的错误从一开始就很清楚。
TLDR :确保正在加载的zip文件的包内容(因此它们应在每个目录中包含__init.py__。)的结构和名称均与您的代码期望的方式相同。>
我试图通过zip加载到spark上下文中的包的格式为
mypkg
file1.py
file2.py
subpkg1
file11.py
subpkg2
file21.py
运行less mypkg.zip
时显示的我的zip
file1.py file2.py subpkg1 subpkg2
所以这里有两件事是错误的。
解决了
zip -r mypkg.zip mypkg
更具体地说,必须制作2个zip文件
用于dist-keras软件包:
cd dist-keras; zip -r distkeras.zip distkeras
请参阅https://github.com/cerndb/dist-keras/tree/master/distkeras
用于distkeras使用的keras软件包(未在整个集群中安装):
cd keras; zip -r keras.zip keras
请参阅https://github.com/keras-team/keras/tree/master/keras
因此,声明启动会话看起来像
conf = SparkConf()
conf.set("spark.app.name", application_name)
conf.set("spark.master", master) #master='yarn-client'
conf.set("spark.executor.cores", `num_cores`)
conf.set("spark.executor.instances", `num_executors`)
conf.set("spark.locality.wait", "0")
conf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer");
# Check if the user is running Spark 2.0 +
if using_spark_2:
from pyspark.sql import SparkSession
sc = SparkSession.builder.config(conf=conf) \
.appName(application_name) \
.getOrCreate()
sc.sparkContext.addPyFile("/home/me/projects/keras-projects/exploring-keras/keras-dist_test/dist-keras/distkeras.zip")
sc.sparkContext.addPyFile("/home/me/projects/keras-projects/exploring-keras/keras-dist_test/keras/keras.zip")
print sc.version
答案 1 :(得分:0)
如果您的模块如下所示
myModule \ n
-初始化 .py
-spark1.py
-spark2.py
不要进入myModule文件夹并添加到zip。您提到的这个错误。
相反,请移出myModule文件夹。 右键单击,然后将myModule文件夹添加到zip文件中,并命名。
这个想法是当spark提取您的zip时,应该存在具有相同名称和名字的myModule文件夹