具有不确定带的散景阶梯图

时间:2018-07-18 23:12:27

标签: python bokeh survival-analysis

我正在尝试使用Bokeh创建具有不确定性(阴影区域间隔)的生存曲线图,例如:http://lifelines.readthedocs.io/en/latest/Examples.html

我尝试使用补丁,但是没有用。

有什么建议吗?

import pandas as pd
from lifelines.datasets import load_dd

data = load_dd()

from lifelines import KaplanMeierFitter
kmf = KaplanMeierFitter()

T = data["duration"]
E = data["observed"]

kmf.fit(T, event_observed=E)

x = kmf.survival_function_.reset_index().timeline
y = kmf.survival_function_.reset_index().KM_estimate

plot = figure( x_axis_label='Days',
  y_axis_label='Survival'
  )

plot.step(x=x, y=y)
show(plot)

kmf.confidence_interval_

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