早上好, 我被封锁了。
我有以下对象:
d1:
a b d e
1: 0 32 0 1
2: 0 40 0 3
3: 23 0 0 2
4: 32 0 32 4
5: 0 0 56 0
w:
[[1]]
[1] "a" "b"
[[2]]
[1] "b" "d"
[[3]]
[1] "a" "b" "e"
我只需要使用单词中包含的列(对于每个“迭代”)就需要行的总和
a b d e f1 f2 f3
1: 0 32 0 1 32 32 33
2: 0 40 0 3 40 40 43
3: 23 0 0 2 23 0 25
4: 32 0 32 4 32 32 36
5: 0 0 56 0 0 56 0
d1[,f1:=rowSums(.SD),.SDcols=w[[1]]]
d1[,f2:=rowSums(.SD),.SDcols=w[[2]]]
d1[,f3:=rowSums(.SD),.SDcols=w[[3]]]
我不能使用循环或lapply
,循环非常慢,并且lapply
的存储效率不高。实际数据是一个1112行和108968列(最好)的矩阵,以及超过400万个字符向量的列表。
谢谢!
数据
d1 <- read.table(h=T,strin=F,text=
"a b d e
0 32 0 1
0 40 0 3
23 0 0 2
32 0 32 4
0 0 56 0")
data.table::setDT(d1)
w <- list(c("a","b"),c("b","d"),c("a","b","e"))
答案 0 :(得分:4)
您的声明
我不能使用循环或lapply,循环非常慢,lapply的内存效率不高。
表示您必须手动输入。考虑有效地使用循环,例如:
for(i in seq_along(w)) {
set(d1, i = NULL, j = paste0("f", i), value = rowSums(d1[, w[[i]], with=FALSE]))
}
结果是:
d1
# a b d e f1 f2 f3
#1: 0 32 0 1 32 32 33
#2: 0 40 0 3 40 40 43
#3: 23 0 0 2 23 0 25
#4: 32 0 32 4 32 32 36
#5: 0 0 56 0 0 56 0
如@Frank在其评论中所述,在这种情况下,替换
rowSums(d1[, w[[i]], with=FALSE])
与
Reduce("+", d1[, w[[i]], with=FALSE])
因为输入不是矩阵(并且rowSums
将其输入强制为矩阵)。实际上,这将是一种更有效的方法,但代价是无法轻松处理NA条目(例如在rowSums
中可能)。